Se você combinar dois aplicativos, isso é possível. Obviamente, a raiz é necessária no seu dispositivo para fazer backup dos dados do aplicativo, como você certamente sabe.
Agora, o primeiro aplicativo que você precisará é o Titanium Backup . Este aplicativo não apenas cria um backup de todos os aplicativos, dados do aplicativo e até dados do sistema no seu cartão SD, contém várias ferramentas úteis para manutenção e pode agendar suas ações - ele também permite enviar os backups para o Dropbox.
Mas sim, eu li que você não tinha como alvo a nuvem, então aqui está o número dois: o FolderSync pode sincronizar seus arquivos / diretórios (e, portanto, também sua pasta de backup no cartão SD) com vários serviços em nuvem e com seus próprios servidores, usando, por exemplo, FTP, FTPS, SFTP, WebDAV ou Samba (Windows Share) para este último.
Embora não exista uma alternativa real ao Titanium Backup , existem algumas para o FolderSync : Titanium Media Sync do mesmo autor que o Titanium Backup suporta Dropbox mais FTP, SFTP e FTPS. E o FTPSyncX suporta FTP, FTPS (SSL), SFTP (SSH), Samba e Dropbox. Eu uso a versão Pro do último e, portanto, posso dizer em primeira mão que ele funciona bem via Wifi - você pode até dizer para sincronizar apenas quando conectado ao Wifi doméstico e executar em determinados intervalos.
Eu quase esqueci que há uma ferramenta que pode servir a ambos os propósitos, backup e sincronização em um: backup rsync para Android . Mas pode ser um pouco mais complicado de configurar, e requer ssh no lado remoto - não é realmente uma boa opção se o seu PC executa o Linux :)