Eu já tentei o seguinte:
Alterando a direção de rolagem do trackpad com AppleScript no Yosemite
Mas não deu certo.
O que eu preciso é quando uso o trackpad interno do macBook Pro, a direção natural de rolagem é ativada e, quando uso um mouse externo, ele é desativado.
Se isso for impossível, que tal a seguinte alternativa: quando conecto um mouse, mude para a direção de rolagem "não natural" e quando desconecto o mouse, volte ao natural.