Fiz o download do Google Chrome e ele mudou automaticamente meu leitor de e-mail padrão de Mail para GMail no Chrome. Fui à seção de preferências do Mail e não vi uma opção para tornar o Mail o leitor padrão.
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Isso pode ser desativado no Google Chrome. Vá para Configurações e selecione "Mostrar configurações avançadas ..." na parte inferior da página. Clique em "Configurações de conteúdo" e clique em "Gerenciar manipuladores" sob o cabeçalho "Manipuladores". Em "Manipuladores de protocolo ativos", altere mailto para "Nenhum".
Em seguida, entre em Mail.app e em Preferences -> General, e certifique-se de "Default E-mail Reader" para "Mail"
Em teoria, deve funcionar como descrito acima. Mas para mim isso não aconteceu, então usei o RCDefaultApps prefpane para restaurar o manipulador do mailto de volta ao Mail.app (no Snow Leopard).