Eu tive que mergulhar um pouco e caçar através de documentação e fóruns, então achei que poderia fazer uma sessão de perguntas e respostas aqui para outras pessoas:
Como habilito o prompt da senha do GnuPG no minibuffer? O changelog do Emacs 25.1 diz:
** pinentry.el permite que a senha do GnuPG seja solicitada através do minibuffer em vez de uma caixa de diálogo gráfica, dependendo se o comando gpg é chamado pelo Emacs (ou seja, a variável de ambiente INSIDE_EMACS está definida). Esse recurso requer versões mais recentes do GnuPG (2.1.5 ou posterior) e Pinentry (0.9.5 ou posterior). Para usar esse recurso, adicione "allow-emacs-pinentry" em "~ / .gnupg / gpg-agent.conf" e recarregue a configuração com "gpgconf --reload gpg-agent".
Fazendo exatamente isso, recebo agora uma mensagem de erro e nem mesmo o prompt da senha gráfica.
Este é o GNU Emacs 25.2.2 no Lubuntu (Ubuntu Xenial) com o GnuPG 2.1.11.