Para não ter polígonos / recursos sobrepostos, normalmente uso um ou mais polígonos para recortar / modelar outros polígonos. Isso geralmente é muito mais rápido do que o rastreamento ao adicionar polígonos etc. Não consigo encontrar essa funcionalidade no QGIS.
O polígono destacado é sobreposto pelo polígono adjacente (oeste / esquerdo) com a aresta reta. Quero cortar o polígono adjacente com o realçado.
Você pode subtrair (recortar) um polígono de outra da mesma camada usando o plug-in Clipper . Você precisa escolher o polígono que deseja recortar e, em seguida, você faz Vector-> Clipper-> Clip e o plug-in subtrai o polígono do maior. Então você escolhe o polígono recortado e o exclui.
Se você não pode escolher o polígono que realmente deseja, porque o QGIS escolhe o outro, você pode usar a ferramenta de identificação (i) e escolher o polígono correto usando a opção Alternar recurso na janela Identify. 
Ao fazer isso, você pode selecionar o polígono desejado quando houver uma sobreposição entre os recursos.
Encontrei a ferramenta que estava procurando! Isso pode ser feito usando o plugin chamado " Clipper ".
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Existe um plugin chamado Digitizing Tools que possui o recurso "Recortar com polígono de outra camada" ...
Na imagem abaixo, estou editando a camada verde e tenho um recurso de polígono selecionado na camada roxa.
Quando clico no 'recortar com polígono de outra camada', ele remove a parte da camada verde que eu selecionei na camada Roxa:
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Você não precisa instalar nenhum plug-in para fazer essa operação: use as ferramentas SAGA. Vá para Processamento> Ferramentas (o painel da ferramenta abre à direita da tela)> SAGA> Ferramentas de polígono de vetor> Auto-interseção de polígono. Essa ferramenta basicamente criará uma nova camada composta de todas as combinações possíveis de polígonos cruzados na mesma camada.
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