Estou tentando extrair os valores de batimetria da minha área de interesse de uma camada raster de batimetria mundial usando a função 'rasterize' no pacote {sp}.
* Edições: Encontrei a função 'extrair', que parece ser mais o que estou procurando.
Isto é o que eu fiz até agora:
> class(subarea0) #This is my area of interest (Eastern Canadian Arctic Sea)
[1] "SpatialPolygons"
attr(,"package")
[1] "sp"
> extent(subarea0)
class : Extent
xmin : -82.21997
xmax : -57.21667
ymin : 60.2
ymax : 78.16666
library(marelac)
data("Bathymetry")#World bathymetric data in library (marelac)
names(Bathymetry);class(Bathymetry);str(Bathymetry)
[1] "x" "y" "z"
[1] "list"
List of 3
$ x: num [1:359] -180 -179 -178 -177 -176 ...
$ y: num [1:180] -89.5 -88.5 -87.5 -86.5 -85.5 ...
$ z: num [1:359, 1:180] 2853 2873 2873 2873 2873 ...
raster_bath<-raster(Bathymetry)#Transformed into a raster layer
extent(raster_bath) <- extent(subarea0)#Transform the extend of my raster to the extend of my SpatialPolygons
>ras_sub0<-rasterize(subarea0,raster_bath)#rasterize my SpatialPolygons (*Edits: not the function that I need here, but I am still interested to learn what results mean)
Found 2 region(s) and 10 polygon(s)
> plot(ras_sub0)
> plot(subarea0, add=TRUE)
> ras_sub0
class : RasterLayer
dimensions : 180, 359, 64620 (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.06964709, 0.0998148 (x, y)
extent : -82.21997, -57.21667, 60.2, 78.16666 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +ellps=WGS84
values : in memory
min value : 1
max value : 2
layer name : layer
Eu não entendo o resultado. Por que estou recebendo duas cores para cada um dos meus polígonos? O que eles querem dizer?
Como posso finalmente obter o contorno da profundidade batimétrica? Isso tem algo a ver com minha resolução ou alteração das dimensões?
* Edições: ok, agora fiz o seguinte:
v <- extract(raster_bath, subarea0)#Extract data from my Raster Layer for the locations of my SpatialPolygons
v é uma lista e não tenho certeza de como / sob que forma religar essas informações com meu polígono espacial ...
Obrigado!
Respostas:
Sua linha
ras_sub0<-rasterize(subarea0,raster_bath)
está apenas pegando o número do índice dos polígonos e atribuindo-o aos valores da varredura.Se você deseja apenas a interseção do seu polígono e da varredura:
Atualização : como o @GodinA observa, parece que intersect () às vezes não retorna uma varredura que tem toda a extensão do polígono! Para contornar isso, você pode cruzar com uma varredura um pouco maior que a original:
fonte
cont <- contour(r3)
em seguida,lines(cont)
não é de R grande?Aqui está outra solução, usando uma função básica de subconjunto em
raster
.fonte