Análise espacial e agrupamento próximo de recursos

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Estou trabalhando no comportamento de marcação em animais vivos em grupo e estou interessado em saber como o comportamento de marcação é afetado por certas características dos grupos vizinhos. Plotamos os territórios de cada grupo a partir de 95% de isótopos de densidade criados usando a-LoCoH. As marcas de cada indivíduo de um grupo são plotadas como uma camada de pontos separada. O comportamento da marcação não parece ser aleatório e parece agrupar-se em torno dos limites com grupos vizinhos. O que eu gostaria de investigar se os indivíduos marcam mais perto de alguns grupos do que perto de outros, por exemplo, os indivíduos marcam menos perto de grupos que estão intimamente relacionados? é possível mostrar que os pontos estão agrupados perto de alguns recursos, mas não de outros?

Qualquer ajuda que possa ser fornecida seria muito apreciada,

Dave Humphries

##### update

Para demonstração, abaixo está uma imagem de quatro territórios (A, B, C e D) e os locais de marcação de dois indivíduos do grupo A. Os grupos A e B estão intimamente relacionados. Os grupos C e D não estão relacionados ao grupo A.

insira a descrição da imagem aqui

Dave Humphries
fonte
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Você é capaz de fornecer dados de amostra?
Om_henners
Desculpe, eu sou novo em empilhar troca - e GIS, quanto a isso, qual é o formato padrão para fornecer dados de amostra? Documento ArcMap?
Dave Humphries
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Os dados de amostra devem ser publicados em um formato GIS aberto, legível por muitos sistemas GIS.
markusN
Alguns dos arquivos envolvidos são shapefiles e, pelo que entendi, atualmente não há como compartilhar esses tipos de arquivos no SE. Fico feliz em fornecer exemplos via e-mail em: [email protected]
Dave Humphries
Outra pergunta enquanto penso sobre isso (retire férias) - os limites a-LoCoH são produzidos a partir do mesmo conjunto de dados de marcação ou de um conjunto de dados diferente? Além disso, que tipo de software você está usando (e você tem acesso)?
Om_henners

Respostas:

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Eu recomendo fortemente dar uma olhada no R , em particular no pacote spatstat do CSRIO. Há um excelente manual / tutorial do Prof. Adrian Baddeley disponível, que o guiará por vários métodos diferentes para análise de padrões de pontos. Particularmente, eu daria uma olhada na Parte VII: Padrões de pontos marcados (especificamente a função de correlação Mark na página 202). As marcas de nota aqui se referem aos dados que são classificados por um atributo em vez de terem um relacionamento numérico.

Há também um capítulo sobre a leitura de dados (usando rgdal , sp etc.) no início do documento. Se você estiver usando o ArcGIS, examinarei o Geospatial Modeling Environment como uma maneira de vincular os dados no R e no ArcGIS; caso contrário, o QGIS possui o manageR, que fará o mesmo.

Por fim, o @whuber (entre muitos outros) aqui no GIS SE tem uma enorme quantidade de experiência em R, então faça perguntas conforme as encontra ou tente agarrá-lo no bate-papo.

om_henners
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Muito obrigado por suas sugestões. Vou tentar o pacote spatstat e ver como vou.
Dave Humphries