Fiz isso por acidente há alguns meses, embora tenha sido com linhas e tenha sido uma classe muito grande (acho que foi da ordem de 10 milhões de recursos). Também não me lembro se era o SQL Server 2008 ou 2012.
Uma coisa que notei no ArcMap foi que tudo estava muito, muito lento. Eu perfilei isso. Encontrou a consulta que estava causando a lentidão e a inseriu no SSMS e determinou que era o método Filter o culpado (iirc, o ArcMap usa o Filter com um envelope para obter OIDs). O SQL Server estava trazendo de volta todas as linhas da tabela!
Quando mudei para a geografia, o Filter estava retornando o número correto de recursos para a geometria especificada.
Não me lembro de outros métodos se comportando mal, mas não deixei os dados do 4326 na geometria SQL tempo suficiente para descobrir.
Se o tamanho da sua mesa não for muito grande, isso pode não importar. Mas é algo a ter em mente para tabelas maiores. Também não importa se o QGIS não usa Filter
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