Além da resposta de John Cavan , se você descartou algum problema médico, seu cão provavelmente uiva no avião para fazê-lo desaparecer - e está funcionando!
Se os aviões passarem sobre sua casa com frequência suficiente, você vai querer dessensibilizar seu cão ao barulho.
Tente pesquisar ruídos de avião no YouTube e reproduza-os em um volume com o qual seu cão se sinta confortável. Recompensa com muitas guloseimas e elogios.
Aumente o volume em etapas muito pequenas, pois você vai desfazer muito do trabalho se julgar mal os limites do seu cão e ele começar a uivar.
Tenha muita paciência, provavelmente levará um tempo para o seu cão se acostumar com o barulho e associá-lo a coisas boas acontecendo (TM).
Ele pode estar achando o ruído do motor perturbador ou irritante (o mesmo pode ser dito para a reação humana também) e, por isso, está vocalizando seu descontentamento. Eu tenho que ser honesto, acho que nunca ouvi falar disso antes, por isso pode valer a pena conferir a audição e os ouvidos dele para serem seguros.