Instalando SciPy e NumPy usando pip

Estou tentando criar as bibliotecas necessárias em um pacote que estou distribuindo. Requer as bibliotecas SciPy e NumPy . Enquanto desenvolvia, instalei ambos usando

apt-get install scipy

que instalou o SciPy 0.9.0 e o NumPy 1.5.1 e funcionou bem.

Gostaria de fazer o mesmo usando pip install- para poder especificar dependências em um setup.py do meu próprio pacote.

O problema é que, quando tento:

pip install 'numpy==1.5.1'

Funciona bem.

Mas então

pip install 'scipy==0.9.0'

falha miseravelmente, com

raise self.notfounderror(self.notfounderror.__doc__)

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError:

Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.

Directories to search for the libraries can be specified in the

numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting

the BLAS environment variable.

Como faço para que funcione?

Estou assumindo a experiência do Linux na minha resposta; Descobri que existem três pré-requisitos pip install scipypara prosseguir bem.

Acesse aqui: Instalando o SciPY

Siga as instruções para baixar, construir e exportar a variável env para BLAS e, em seguida, LAPACK . Cuidado para não apenas cortar e colar cegamente os comandos do shell - haverá algumas linhas que você precisará selecionar, dependendo da sua arquitetura etc., e precisará corrigir / adicionar os diretórios corretos que ele assume incorretamente como bem.

A terceira coisa que você pode precisar é instalar o numpy-f2py ou o equivalente.

Ah, sim, e por último, você pode precisar instalar o gcc-gfortran, pois as bibliotecas acima são fonte do Fortran .

Isso funcionou para mim no Ubuntu 14.04:

sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev gfortran
pip install scipy

você precisa dos pacotes libblas e liblapack dev se estiver usando o Ubuntu.

aptitude install libblas-dev liblapack-dev
pip install scipy

Como as instruções anteriores para instalação com o yum estão quebradas, aqui estão as instruções atualizadas para instalação em algo como o fedora. Eu testei isso no "Amazon Linux AMI 2016.03"

sudo yum install atlas-devel lapack-devel blas-devel libgfortran
pip install scipy

Eu estava trabalhando em um projeto que dependia de numpy e scipy. Em uma instalação limpa do Fedora 23, usando um ambiente virtual python para Python 3.4 (também funcionou para Python 2.7), e com o seguinte em meu setup.py (no setup()método)

setup_requires=[
    'numpy',
],
install_requires=[
    'numpy',
    'scipy',
],

Eu descobri que precisava executar o seguinte para começar pip install -e .a trabalhar:

pip install --upgrade pip

e

sudo dnf install atlas-devel gcc-{c++,gfortran} subversion redhat-rpm-config

O redhat-rpm-configé para o uso de scipy redhat-hardened-cc1em oposição ao regularcc1

No Windows python 3.5 , consegui instalar scipyusando conda not pip :

conda install scipy

Que sistema operacional é esse? A resposta pode depender do sistema operacional envolvido. No entanto, parece que você precisa encontrar esta biblioteca BLAS e instalá-la. Não parece estar no PIP (você terá que fazê-lo manualmente), mas se você o instalar, deverá permitir que você progrida na instalação do SciPy.

no meu caso, a atualização do pip fez o truque. Além disso, instalei o scipy com o parâmetro -U (atualize todos os pacotes para a última versão disponível)