Omitir linhas contendo coluna específica de NA

Quero saber como omitir NAvalores em um quadro de dados, mas apenas em algumas colunas em que estou interessado.

Por exemplo,

DF <- data.frame(x = c(1, 2, 3), y = c(0, 10, NA), z=c(NA, 33, 22))

mas eu só quero omitir os dados onde yestá NA, portanto o resultado deve ser

  x  y  z
1 1  0 NA
2 2 10 33

na.omitparece excluir todas as linhas contêm qualquer NA.

Alguém pode me ajudar com essa pergunta simples?

Mas se agora eu mudar a pergunta como:

DF <- data.frame(x = c(1, 2, 3,NA), y = c(1,0, 10, NA), z=c(43,NA, 33, NA))

Se eu quiser omitir apenas x=naou z=na, onde posso colocar a |função in?

Você pode usar a complete.casesfunção e colocá-la em uma função assim:

DF <- data.frame(x = c(1, 2, 3), y = c(0, 10, NA), z=c(NA, 33, 22))

completeFun <- function(data, desiredCols) {
  completeVec <- complete.cases(data[, desiredCols])
  return(data[completeVec, ])
}

completeFun(DF, "y")
#   x  y  z
# 1 1  0 NA
# 2 2 10 33

completeFun(DF, c("y", "z"))
#   x  y  z
# 2 2 10 33

EDIT: retorna apenas linhas sem NAs

Se você deseja eliminar todas as linhas com pelo menos uma NAem qualquer coluna, basta usar a complete.casesfunção:

DF[complete.cases(DF), ]
#   x  y  z
# 2 2 10 33

Ou se completeFunjá estiver enraizado no seu fluxo de trabalho;)

completeFun(DF, names(DF))

Usar is.na

DF <- data.frame(x = c(1, 2, 3), y = c(0, 10, NA), z=c(NA, 33, 22))
DF[!is.na(DF$y),]

Hadley tidyracabou de receber essa função incríveldrop_na

library(tidyr)
DF %>% drop_na(y)
  x  y  z
1 1  0 NA
2 2 10 33

Use 'subconjunto'

DF <- data.frame(x = c(1, 2, 3), y = c(0, 10, NA), z=c(NA, 33, 22))
subset(DF, !is.na(y))

É possível usar na.omitpara data.table:

na.omit(data, cols = c("x", "z"))

Tente o seguinte:

cc=is.na(DF$y)
m=which(cc==c("TRUE"))
DF=DF[-m,]

Omita a linha se uma das duas colunas específicas contiver <NA>.

DF[!is.na(DF$x)&!is.na(DF$z),]

Apenas tente o seguinte:

DF %>% t %>% na.omit %>% t

Ele transpõe o quadro de dados e omite linhas nulas que eram 'colunas' antes da transposição e, em seguida, você o transpõe.