Removendo o espaço em branco ao redor de uma imagem salva no matplotlib

Preciso tirar uma foto e salvá-la após algum processo. A figura fica bem quando a exibo, mas depois de salvá-la, fiquei com um espaço em branco ao redor da imagem salva. Eu tentei a 'tight'opção pelo savefigmétodo, também não funcionou. O código:

  import matplotlib.image as mpimg
  import matplotlib.pyplot as plt

  fig = plt.figure(1)
  img = mpimg.imread(path)
  plt.imshow(img)
  ax=fig.add_subplot(1,1,1)

  extent = ax.get_window_extent().transformed(fig.dpi_scale_trans.inverted())
  plt.savefig('1.png', bbox_inches=extent)

  plt.axis('off') 
  plt.show()

Estou tentando desenhar um gráfico básico usando o NetworkX em uma figura e salvá-lo. Percebi que sem o gráfico ele funciona, mas quando adicionado um gráfico, recebo espaço em branco ao redor da imagem salva;

import matplotlib.image as mpimg
import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx

G = nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_node(2)
G.add_node(3)
G.add_edge(1,3)
G.add_edge(1,2)
pos = {1:[100,120], 2:[200,300], 3:[50,75]}

fig = plt.figure(1)
img = mpimg.imread("C:\\images\\1.jpg")
plt.imshow(img)
ax=fig.add_subplot(1,1,1)

nx.draw(G, pos=pos)

extent = ax.get_window_extent().transformed(fig.dpi_scale_trans.inverted())
plt.savefig('1.png', bbox_inches = extent)

plt.axis('off') 
plt.show()

Não posso afirmar que sei exatamente por que ou como minha “solução” funciona, mas era isso que eu precisava fazer quando quis plotar o esboço de algumas seções de aerofólio - sem margens brancas - em um arquivo PDF. (Observe que eu usei o matplotlib dentro de um notebook IPython, com o sinalizador -pylab.)

plt.gca().set_axis_off()
plt.subplots_adjust(top = 1, bottom = 0, right = 1, left = 0, 
            hspace = 0, wspace = 0)
plt.margins(0,0)
plt.gca().xaxis.set_major_locator(plt.NullLocator())
plt.gca().yaxis.set_major_locator(plt.NullLocator())
plt.savefig("filename.pdf", bbox_inches = 'tight',
    pad_inches = 0)

Tentei desativar partes diferentes disso, mas isso sempre leva a uma margem branca em algum lugar. Você pode até modificar isso para impedir que linhas gordas próximas aos limites da figura sejam raspadas pela falta de margens.

Você pode remover o preenchimento de espaço em branco, definindo bbox_inches="tight"em savefig:

plt.savefig("test.png",bbox_inches='tight')

Você terá que colocar o argumento bbox_inchescomo uma string, talvez seja por isso que não funcionou anteriormente para você.

Possíveis duplicatas:

Gráficos Matplotlib: removendo eixos, legendas e espaços em branco

Como definir as margens para uma figura do matplotlib?

Reduzir as margens esquerda e direita no gráfico matplotlib

Depois de tentar as respostas acima sem sucesso (e várias outras postagens de pilha), o que finalmente funcionou para mim foi apenas

plt.gca().set_axis_off()
plt.subplots_adjust(top = 1, bottom = 0, right = 1, left = 0, 
            hspace = 0, wspace = 0)
plt.margins(0,0)
plt.savefig("myfig.pdf")

É importante ressaltar que isso não inclui os argumentos bbox ou padding.

Encontrei algo de Arvind Pereira ( http://robotics.usc.edu/~ampereir/wordpress/?p=626 ) e parecia funcionar para mim:

plt.savefig(filename, transparent = True, bbox_inches = 'tight', pad_inches = 0)

A função a seguir incorpora a resposta de johannes-s acima. Eu testei com plt.figuree plt.subplots()com vários eixos, e funciona muito bem.

def save(filepath, fig=None):
    '''Save the current image with no whitespace
    Example filepath: "myfig.png" or r"C:\myfig.pdf" 
    '''
    import matplotlib.pyplot as plt
    if not fig:
        fig = plt.gcf()

    plt.subplots_adjust(0,0,1,1,0,0)
    for ax in fig.axes:
        ax.axis('off')
        ax.margins(0,0)
        ax.xaxis.set_major_locator(plt.NullLocator())
        ax.yaxis.set_major_locator(plt.NullLocator())
    fig.savefig(filepath, pad_inches = 0, bbox_inches='tight')

Eu achei os seguintes códigos funcionar perfeitamente para o trabalho.

fig = plt.figure(figsize=[6,6])
ax = fig.add_subplot(111)
ax.imshow(data)
ax.axes.get_xaxis().set_visible(False)
ax.axes.get_yaxis().set_visible(False)
ax.set_frame_on(False)
plt.savefig('data.png', dpi=400, bbox_inches='tight',pad_inches=0)

Eu segui essa sequência e funcionou como um encanto.

plt.axis("off")
fig=plt.imshow(image array,interpolation='nearest')
fig.axes.get_xaxis().set_visible(False)
fig.axes.get_yaxis().set_visible(False)
plt.savefig('destination_path.pdf',
    bbox_inches='tight', pad_inches=0, format='pdf', dpi=1200)

Para quem quer trabalhar em pixels em vez de polegadas, isso funcionará.

Além do habitual, você também precisará

from matplotlib.transforms import Bbox

Então você pode usar o seguinte:

my_dpi = 100 # Good default - doesn't really matter

# Size of output in pixels
h = 224
w = 224

fig, ax = plt.subplots(1, figsize=(w/my_dpi, h/my_dpi), dpi=my_dpi)

ax.set_position([0, 0, 1, 1]) # Critical!

# Do some stuff
ax.imshow(img)
ax.imshow(heatmap) # 4-channel RGBA
ax.plot([50, 100, 150], [50, 100, 150], color="red")

ax.axis("off")

fig.savefig("saved_img.png",
            bbox_inches=Bbox([[0, 0], [w/my_dpi, h/my_dpi]]),
            dpi=my_dpi)

Uma abordagem muito mais simples que encontrei é usar plt.imsave:

    import matplotlib.pyplot as plt
    arr = plt.imread(path)
    plt.imsave('test.png', arr)

Você pode tentar isso. Resolveu o meu problema.

import matplotlib.image as mpimg
img = mpimg.imread("src.png")
mpimg.imsave("out.png", img, cmap=cmap)

Se você deseja exibir o que deve ser salvo, recomendo usar a plt.tight_layouttransformação, que é realmente mais preferível, pois não faz cortes desnecessários ao usarplt.savefig

import matplotlib as plt    
plt.plot([1,2,3], [1,2,3])
plt.tight_layout(pad=0)
plt.savefig('plot.png')

Isso funciona para mim, salvando uma matriz numpy plotada com imshow para arquivar

import matplotlib.pyplot as plt

fig = plt.figure(figsize=(10,10))
plt.imshow(img) # your image here
plt.axis("off")
plt.subplots_adjust(top = 1, bottom = 0, right = 1, left = 0, 
        hspace = 0, wspace = 0)
plt.savefig("example2.png", box_inches='tight', dpi=100)
plt.show()