De um dataframe como este
test <- data.frame('id'= rep(1:5,2), 'string'= LETTERS[1:10])
test <- test[order(test$id), ]
rownames(test) <- 1:10
> test
id string
1 1 A
2 1 F
3 2 B
4 2 G
5 3 C
6 3 H
7 4 D
8 4 I
9 5 E
10 5 J
Quero criar um novo com a primeira linha de cada par id / string. Se sqldf aceitasse o código R dentro dele, a consulta poderia ter a seguinte aparência:
res <- sqldf("select id, min(rownames(test)), string
from test
group by id, string")
> res
id string
1 1 A
3 2 B
5 3 C
7 4 D
9 5 E
Existe uma solução sem a criação de uma nova coluna como
test$row <- rownames(test)
e executando a mesma consulta sqldf com min (linha)?
Respostas:
Você pode usar
duplicated
para fazer isso muito rapidamente.Benchmarks, para os fanáticos por velocidade:
ju <- function() test[!duplicated(test$id),] gs1 <- function() do.call(rbind, lapply(split(test, test$id), head, 1)) gs2 <- function() do.call(rbind, lapply(split(test, test$id), `[`, 1, )) jply <- function() ddply(test,.(id),function(x) head(x,1)) jdt <- function() { testd <- as.data.table(test) setkey(testd,id) # Initial solution (slow) # testd[,lapply(.SD,function(x) head(x,1)),by = key(testd)] # Faster options : testd[!duplicated(id)] # (1) # testd[, .SD[1L], by=key(testd)] # (2) # testd[J(unique(id)),mult="first"] # (3) # testd[ testd[,.I[1L],by=id] ] # (4) needs v1.8.3. Allows 2nd, 3rd etc } library(plyr) library(data.table) library(rbenchmark) # sample data set.seed(21) test <- data.frame(id=sample(1e3, 1e5, TRUE), string=sample(LETTERS, 1e5, TRUE)) test <- test[order(test$id), ] benchmark(ju(), gs1(), gs2(), jply(), jdt(), replications=5, order="relative")[,1:6] # test replications elapsed relative user.self sys.self # 1 ju() 5 0.03 1.000 0.03 0.00 # 5 jdt() 5 0.03 1.000 0.03 0.00 # 3 gs2() 5 3.49 116.333 2.87 0.58 # 2 gs1() 5 3.58 119.333 3.00 0.58 # 4 jply() 5 3.69 123.000 3.11 0.51
Vamos tentar de novo, mas apenas com os contendores da primeira bateria e com mais dados e mais replicações.
set.seed(21) test <- data.frame(id=sample(1e4, 1e6, TRUE), string=sample(LETTERS, 1e6, TRUE)) test <- test[order(test$id), ] benchmark(ju(), jdt(), order="relative")[,1:6] # test replications elapsed relative user.self sys.self # 1 ju() 100 5.48 1.000 4.44 1.00 # 2 jdt() 100 6.92 1.263 5.70 1.15
fonte
!duplicated(x)
encontra o primeiro de cada grupo, mesmo se não estiver classificado, iiuc.Eu sou a favor da abordagem dplyr.
group_by(id)
seguido por qualquer umfilter(row_number()==1)
ouslice(1)
ouslice_head(1)
# (dplyr => 1.0)top_n(n = -1)
top_n()
usa internamente a função de classificação. Negativo seleciona na parte inferior da classificação.Em alguns casos, pode ser necessário organizar os ids após group_by.
library(dplyr) # using filter(), top_n() or slice() m1 <- test %>% group_by(id) %>% filter(row_number()==1) m2 <- test %>% group_by(id) %>% slice(1) m3 <- test %>% group_by(id) %>% top_n(n = -1)
Todos os três métodos retornam o mesmo resultado
# A tibble: 5 x 2 # Groups: id [5] id string <int> <fct> 1 1 A 2 2 B 3 3 C 4 4 D 5 5 E
fonte
slice
também.slice(x)
é um atalho parafilter(row_number() %in% x)
.data.table
para umdata.frame
para que isso funcione?data.table
herda dodata.frame
então, em muitos casos, você pode usar os comandos dplyr em umdata.table
. O exemplo acima, por exemplo, também funciona setest
for adata.table
. Consulte, por exemplo, stackoverflow.com/questions/13618488/… para uma explicação mais detalhadaA respeito
DT <- data.table(test) setkey(DT, id) DT[J(unique(id)), mult = "first"]
Editar
Há também um método único para o
data.tables
qual retornará a primeira linha por chavejdtu <- function() unique(DT)
Eu acho que, se você está pedindo
test
fora do benchmark, então você pode remover a conversãosetkey
edata.table
do benchmark também (como o setkey basicamente classifica por id, o mesmo queorder
).set.seed(21) test <- data.frame(id=sample(1e3, 1e5, TRUE), string=sample(LETTERS, 1e5, TRUE)) test <- test[order(test$id), ] DT <- data.table(DT, key = 'id') ju <- function() test[!duplicated(test$id),] jdt <- function() DT[J(unique(id)),mult = 'first'] library(rbenchmark) benchmark(ju(), jdt(), replications = 5) ## test replications elapsed relative user.self sys.self ## 2 jdt() 5 0.01 1 0.02 0 ## 1 ju() 5 0.05 5 0.05 0
e com mais dados
** Edite com método único **
set.seed(21) test <- data.frame(id=sample(1e4, 1e6, TRUE), string=sample(LETTERS, 1e6, TRUE)) test <- test[order(test$id), ] DT <- data.table(test, key = 'id') test replications elapsed relative user.self sys.self 2 jdt() 5 0.09 2.25 0.09 0.00 3 jdtu() 5 0.04 1.00 0.05 0.00 1 ju() 5 0.22 5.50 0.19 0.03
O método exclusivo é mais rápido aqui.
fonte
unique(DT,by="id")
trabalha diretamentedata.table
versão> = 1.9.8, oby
argumento padrão paraunique
éby = seq_along(x)
(todas as colunas), em vez do padrão anteriorby = key(x)
Uma
ddply
opção simples :ddply(test,.(id),function(x) head(x,1))
Se a velocidade for um problema, uma abordagem semelhante pode ser adotada com
data.table
:testd <- data.table(test) setkey(testd,id) testd[,.SD[1],by = key(testd)]
ou isso pode ser consideravelmente mais rápido:
testd[testd[, .I[1], by = key(testd]$V1]
fonte
agora, para
dplyr
adicionar um contador distinto.df %>% group_by(aa, bb) %>% summarise(first=head(value,1), count=n_distinct(value))
Você cria grupos, eles resumem dentro de grupos.
Se os dados forem numéricos, você pode usar:
first(value)
[também hálast(value)
] no lugar dehead(value, 1)
consulte: http://cran.rstudio.com/web/packages/dplyr/vignettes/introduction.html
Cheio:
> df Source: local data frame [16 x 3] aa bb value 1 1 1 GUT 2 1 1 PER 3 1 2 SUT 4 1 2 GUT 5 1 3 SUT 6 1 3 GUT 7 1 3 PER 8 2 1 221 9 2 1 224 10 2 1 239 11 2 2 217 12 2 2 221 13 2 2 224 14 3 1 GUT 15 3 1 HUL 16 3 1 GUT > library(dplyr) > df %>% > group_by(aa, bb) %>% > summarise(first=head(value,1), count=n_distinct(value)) Source: local data frame [6 x 4] Groups: aa aa bb first count 1 1 1 GUT 2 2 1 2 SUT 2 3 1 3 SUT 3 4 2 1 221 3 5 2 2 217 3 6 3 1 GUT 2
fonte
dplyr
sem exigir a escrita de uma declaração para cada coluna a ser incluída (veja a resposta do atomman abaixo, por exemplo). Also I'm not sure what *"if data is numeric"* has anything to do with whether or not one would use
primeiro (valor) `vshead(value)
(ou apenasvalue[1]
)(1) O SQLite tem uma
rowid
pseudocoluna embutida, então isso funciona:sqldf("select min(rowid) rowid, id, string from test group by id")
dando:
rowid id string 1 1 1 A 2 3 2 B 3 5 3 C 4 7 4 D 5 9 5 E
(2) Também
sqldf
tem umrow.names=
argumento:sqldf("select min(cast(row_names as real)) row_names, id, string from test group by id", row.names = TRUE)
dando:
id string 1 1 A 3 2 B 5 3 C 7 4 D 9 5 E
(3) Uma terceira alternativa que mistura os elementos das duas anteriores pode ser ainda melhor:
sqldf("select min(rowid) row_names, id, string from test group by id", row.names = TRUE)
dando:
id string 1 1 A 3 2 B 5 3 C 7 4 D 9 5 E
Observe que todos os três contam com uma extensão SQLite para SQL em que o uso de
min
oumax
é garantido para resultar na escolha de outras colunas na mesma linha. (Em outros bancos de dados baseados em SQL, isso pode não ser garantido.)fonte
Uma opção de base R é o
split()
-lapply()
-do.call()
idiom:> do.call(rbind, lapply(split(test, test$id), head, 1)) id string 1 1 A 2 2 B 3 3 C 4 4 D 5 5 E
Uma opção mais direta é
lapply()
a[
função:> do.call(rbind, lapply(split(test, test$id), `[`, 1, )) id string 1 1 A 2 2 B 3 3 C 4 4 D 5 5 E
O espaço de vírgula
1, )
no final dalapply()
chamada é essencial, pois isso equivale a chamar[1, ]
para selecionar a primeira linha e todas as colunas.fonte