GraphViz - Como conectar subgráficos?

Na DOTlinguagem para GraphViz, estou tentando representar um diagrama de dependência. Eu preciso ter nós dentro de um contêiner e poder tornar nós e / ou contêineres dependentes de outros nós e / ou contêineres.

Estou usando subgraphpara representar meus contêineres. A vinculação de nó funciona muito bem, mas não consigo descobrir como conectar subgráficos.

Dado o programa abaixo, preciso conectar-me cluster_1e cluster_2com uma seta, mas qualquer coisa que tentei cria novos nós em vez de conectar os clusters:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana"];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Renders fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Both of these create new nodes
    cluster_1 -> cluster_2;
    "Container A" -> "Container C";
}

O manual do usuário do DOT fornece o seguinte exemplo de gráfico com clusters com arestas entre clusters:

IMPORTANTE: A compound=truedeclaração inicial é necessária.

digraph G {
  compound=true;
  subgraph cluster0 {
    a -> b;
    a -> c;
    b -> d;
    c -> d;
  }
  subgraph cluster1 {
    e -> g;
    e -> f;
  }
  b -> f [lhead=cluster1];
  d -> e;
  c -> g [ltail=cluster0,lhead=cluster1];
  c -> e [ltail=cluster0];
  d -> h;
}

... e arestas entre nós e clusters:

Para facilitar a referência, a solução descrita na resposta do HighPerformanceMark, aplicada diretamente à pergunta original, tem a seguinte aparência:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana" compound=true];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Edges between nodes render fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Edges that directly connect one cluster to another
    "Item 1" -> "Item 3" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_1];
    "Item 1" -> "Item 5" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_2];
}

O compound=truena graphdeclaração é vital. Isso produz saída:

Observe que eu alterei as arestas para referenciar os nós no cluster, adicionei os atributos ltail e lhead a cada borda, especificando o nome do cluster e adicionei o atributo no nível do gráfico 'composite = true'.

Com relação à preocupação de que alguém possa querer conectar um cluster sem nós, minha solução foi sempre adicionar um nó a cada cluster, renderizado com style = plaintext. Use esse nó para rotular o cluster (em vez do atributo "label" interno do cluster, que deve ser definido como a sequência vazia (em Python label='""'). Isso significa que não estou mais adicionando arestas que conectam clusters diretamente, mas funciona na minha situação particular.

Verifique se você está usando o fdplayout do arquivo. Eu não acho que neatosuporta clusters.