Como fazer um gráfico de dispersão com círculos vazios em Python?

No Python, com o Matplotlib, como um gráfico de dispersão com círculos vazios pode ser plotado? O objetivo é desenhar círculos vazios em torno de alguns dos discos coloridos já plotados scatter(), de modo a destacá-los, idealmente sem ter que redesenhar os círculos coloridos.

Eu tentei facecolors=None, sem sucesso.

Na documentação para dispersão:

Optional kwargs control the Collection properties; in particular:

    edgecolors:
        The string ‘none’ to plot faces with no outlines
    facecolors:
        The string ‘none’ to plot unfilled outlines

Tente o seguinte:

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 

x = np.random.randn(60) 
y = np.random.randn(60)

plt.scatter(x, y, s=80, facecolors='none', edgecolors='r')
plt.show()

Nota: Para outros tipos de gráficos, consulte este post sobre o uso de markeredgecolore markerfacecolor.

Isso funcionaria?

plt.scatter(np.random.randn(100), np.random.randn(100), facecolors='none')

ou usando plot ()

plt.plot(np.random.randn(100), np.random.randn(100), 'o', mfc='none')

Aqui está outra maneira: isso adiciona um círculo aos eixos atuais, plotagem ou imagem ou o que for:

from matplotlib.patches import Circle  # $matplotlib/patches.py

def circle( xy, radius, color="lightsteelblue", facecolor="none", alpha=1, ax=None ):
    """ add a circle to ax= or current axes
    """
        # from .../pylab_examples/ellipse_demo.py
    e = Circle( xy=xy, radius=radius )
    if ax is None:
        ax = pl.gca()  # ax = subplot( 1,1,1 )
    ax.add_artist(e)
    e.set_clip_box(ax.bbox)
    e.set_edgecolor( color )
    e.set_facecolor( facecolor )  # "none" not None
    e.set_alpha( alpha )

(Os círculos na imagem são compactados em reticências porque imshow aspect="auto").

No matplotlib 2.0, existe um parâmetro chamado fillstyle que permite um melhor controle na maneira como os marcadores são preenchidos. No meu caso, usei-o com barras de erro, mas funciona para marcadores em geral http://matplotlib.org/api/_as_gen/matplotlib.axes.Axes.errorbar.html

fillstyleaceita os seguintes valores: ['full' | 'esquerda' | 'certo' | 'fundo' | 'top' | 'Nenhum']

Há duas coisas importantes a serem lembradas ao usar fillstyle,

1) Se mfc for definido com qualquer tipo de valor, ele terá prioridade; portanto, se você definiu o estilo de preenchimento como 'none', isso não entrará em vigor. Portanto, evite usar mfc em conjunção com fillstyle

2) Você pode controlar a largura da borda do marcador (usando markeredgewidthou mew) porque se o marcador for relativamente pequeno e a largura da borda for espessa, os marcadores parecerão preenchidos, mesmo que não sejam.

A seguir, um exemplo usando barras de erro:

myplot.errorbar(x=myXval, y=myYval, yerr=myYerrVal, fmt='o', fillstyle='none', ecolor='blue',  mec='blue')

Baseando-se no exemplo de Gary Kerr e, conforme proposto aqui, é possível criar círculos vazios relacionados aos valores especificados com o seguinte código:

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 
from matplotlib.markers import MarkerStyle

x = np.random.randn(60) 
y = np.random.randn(60)
z = np.random.randn(60)

g=plt.scatter(x, y, s=80, c=z)
g.set_facecolor('none')
plt.colorbar()
plt.show()

Então, suponho que você queira destacar alguns pontos que se encaixam em um determinado critério. Você pode usar o comando do Prelude para fazer um segundo gráfico de dispersão dos pontos iluminados com um círculo vazio e uma primeira chamada para plotar todos os pontos. Verifique se o parâmetro s é suficientemente pequeno para que os círculos vazios maiores incluam os menores preenchidos.

A outra opção é não usar dispersão e desenhar os patches individualmente usando o comando circle / ellipse. Estes estão em matplotlib.patches, aqui está um código de exemplo sobre como desenhar retângulos de círculos etc.