'Tabelas' de dependência opcionais ausentes. Em pandas to_hdf

código a seguir está me dando erro.

import pandas as pd
df = pd.DataFrame({'a' : [1,2,3]})
df.to_hdf('temp.h5', key='df', mode='w')

Isso está me dando erro.

'Tabelas' de dependência opcionais ausentes. Use pip ou conda para instalar tabelas.
Eu já tentei o ImportError HDFStore requer PyTables Nenhum módulo chamado tabelas . Ainda é o mesmo erro.
Estou recebendo o mesmo erro ao ler o arquivo hdf. E tablesjá está instalado para o meu python.

Algumas informações da versão.

python 3.7.4

pandas 0.25.2

windows10

PS: Você pode reproduzir isso em repl https://repl.it/ .

Atualização :

Eu tentei correr a seguir.

import tables

e recebeu este erro:

ImportError: Não foi possível carregar nenhum dos ['hdf5.dll', 'hdf5dll.dll'], verifique se ele pode ser encontrado no caminho do sistema.

Parece que os pandas não estão dando uma mensagem precisa para isso. Está apenas dizendo falta de dependência quando está realmente presente.
Se alguém souber como resolver isso. Isso vai ajudar.

python pandas pip hdf5 pytables Poojan
fonte

Qual é o seu sistema operacional, o local executável em python e qual IDE você está usando (PyCharm, VSCode, etc?) Além disso, qual versão do Pandas e Python você está usando?

James

No repl.it, seu código funciona bem quando você adiciona tabelas == 3.6.0 como um pacote no repl.

Davide Fiocco

@DavideFiocco parece que agora está trabalhando em relt.it. Eu não estou na minha estação de trabalho em casa agora. Quando eu voltar para casa, vou verificar e atualizar a pergunta.

Poojan

As informações da versão @James são mencionadas em questão. Estou usando o notebook jupyter para executar o código.

Poojan 23/10/19

na minha máquina Linux, o pacote parece ser chamado pytables. Você pode verificar se a instalação pytablesresolve seu problema? Seu snippet de código funciona bem com o pytablesinstalado.

Sergey Bushmanov

Respostas:

O problema estava com tables.
Quando eu estava instalando tablesusando pip no diretório local do usuário usando o seguinte comando, ele não está funcionando.

pip install --user tables

A execução import tablesresultará neste erro.

ImportError: Não foi possível carregar nenhum dos ['hdf5.dll', 'hdf5dll.dll'], verifique se ele pode ser encontrado no caminho do sistema
A solução que funcionou para mim é desinstalar tabelas. E instale-o no diretório python. (ou onde seu python está instalado). without --user option. Você pode exigir acesso de administrador / raiz para isso, dependendo da localização do seu python.
Para mim, o meu caminho python foi C:\Program Files\Python37-64\python.exee instalar sob c:\program files\python37-64\lib\site-packages\funcionou para mim.
Espero que isto ajude. Não sei por que a instalação no diretório de usuários não está funcionando para tabelas. Se alguém puder encontrar o motivo disso, poste aqui.

Poojan
fonte

Para usuários conda:

conda install pytables

Mateus
fonte

Perfeito. Instala as tabelas e o numexpr nos pacotes do site.

Peter