Perguntas com a marcação «efficiency»

Eu tenho vários problemas desafiadores de otimização global não convexa para resolver. Atualmente, uso o Optimization Toolbox do MATLAB (especificamente, fmincon()com o algoritmo = 'sqp'), o que é bastante eficaz . No entanto, a maior parte do meu código está em Python, e eu adoraria fazer a...

Uma das principais questões com as quais temos de lidar em simulações moleculares é o cálculo de forças dependentes da distância. Se pudermos restringir as funções de força e distância para ter potências iguais da distância de separação , podemos calcular o quadrado da distância r 2 = r ⋅ r e não...

Meu grupo de pesquisa se concentra na dinâmica molecular, que obviamente pode gerar gigabytes de dados como parte de uma única trajetória que deve ser analisada. Vários dos problemas com os quais estamos preocupados envolvem correlações no conjunto de dados, o que significa que precisamos...

Estou executando simulações de dinâmica molecular (MD) usando vários pacotes de software, como Gromacs e DL_POLY. O Gromacs agora suporta os algoritmos de decomposição de partículas e de domínio. Por padrão, as simulações do Gromacs usam a decomposição de domínio, embora por muitos anos, até...

A diferenciação automática nos permite avaliar numericamente a derivada de um programa em uma entrada específica. Existe um teorema de que esse cálculo pode ser feito a um custo inferior a cinco vezes o custo para executar o programa original. Esse fator de cinco é um limite superior. Em que...

Estou interessado em estabelecer cálculos para verificar se um critério de distância é atendido: ou seja, a distância entre um vetor vetor x j deve ser menor que algum valor r m a x . Meus dados são particionados de acordo com uma grade ortogonal de coordenadas. Como meu ponto de corte é menor que...

Eu li que, por exemplo, se eu tenho um forloop duplo que percorre os índices de uma matriz, é mais eficiente colocar o índice de execução da coluna no loop externo. Por exemplo: a=zeros(1000); for j=1:1000 for i=1:1000 a(i,j)=1; end end Qual é a maneira mais eficiente de codificá-lo se eu...

Qual é a maneira mais avançada de implementar funções especiais de precisão dupla? Preciso da seguinte integral: para e , que pode ser escrita em termos da função gama incompleta inferior. Aqui está minha implementação de Fortran e C: m=0,1,2,. . . t>0Fm( t ) = ∫1 10 0você2 me- t u2du = γ( m +...

Estou tentando entender a diferença entre essas duas placas gráficas para computação acadêmica, especificamente para o componente DGEMM. Se olharmos para as estatísticas brutas, ambas têm o mesmo chip GK110, estatísticas comparáveis ​​em praticamente todas as categorias e, acredito, têm a mesma...

Fechadas. Esta questão está fora de tópico . No momento, não está aceitando respostas. Deseja melhorar esta pergunta? Atualize a pergunta para que ela esteja no tópico do Computational Science Stack Exchange. Fechado há 5 anos . Existe um grau de...