Existem algoritmos para detecção da comunidade para gráficos bipartidos (redes de dois modos) implementados no igraph, networkX, R ou Python etc.? Em particular, existe uma implementação em que alguém seria capaz de restringir a detecção de comunidades apenas em um dos dois...
Tenho experiência em codificar OpenMP para máquinas de memória compartilhada (em C e FORTRAN) para realizar tarefas simples como adição de matriz, multiplicação etc. (Apenas para ver como ele compete com o LAPACK). Conheço o OpenMP o suficiente para realizar tarefas simples sem a necessidade de...
Na minha resposta a uma pergunta no MSE referente a uma simulação física hamiltoniana 2D, sugeri o uso de um integrador simplético de ordem superior . Então achei que seria uma boa ideia demonstrar os efeitos de diferentes etapas no tempo na precisão global de métodos com ordens diferentes, e...
Eu tenho um conjunto de dados que está mudando lentamente e preciso acompanhar os autovetores / autovalores de sua matriz de covariância. Estou usando scipy.linalg.eigh, mas é muito caro e não usa o fato de eu já ter uma decomposição que é apenas um pouco incorreta. Alguém pode sugerir uma...
Para redução do modelo, quero calcular os vetores singulares esquerdos associados aos - digamos 20 - maiores valores singulares de uma matriz , em que N ≈ 10 6 e k ≈ 10 3 . Infelizmente, minha matriz A será densa sem nenhuma estrutura.A ∈ RN, kUMA∈RN,kA \in \mathbb R^{N,k}N≈ 106N≈106N\approx 10^6k...
Eu sou um físico que está tentando modelar as características de tensão de corrente de uma junção supercondutor-supercondutor. A equação para este modelo é: Eu( V) = 1e Rn - n∫∞- ∞| E|[ E2- Δ21 1]1 / 2| E+ e V|[ ( E+ e V)2- Δ22]1 / 2[ f( E) - f( E+ e V) ]d
Então, eu estou debatendo se devo ou não aprender o Python. Ao falar com meus professores, o Matlab parece ser a linguagem comum usada na matemática aplicada / ciência da computação no que diz respeito à academia ; enquanto na indústria , meus professores (especialmente aqueles que trabalharam na...
Basicamente, o FEM parece ser um problema praticamente "resolvido". Existem inúmeras estruturas poderosas, como Trilinos, PETSc, FEniCS, Libmesh ou MOOSE. Uma coisa que eles têm em comum: são extremamente "pesados". Primeiro, a instalação normalmente é super dolorosa. Segundo, a interface / API...
Estou procurando o caminho mínimo entre os mínimos de uma superfície potencial que já é conhecida em uma grade. (fonte: http://www.math.nus.edu.sg/~matrw/string/ ) Qualquer ponto no caminho é o mínimo potencial em todas as direções perpendicular ao caminho. Existe algum método SciPy ou...
De acordo com Wolfram Alpha e o sistema de álgebra computacional Sage , a seguinte identidade é válida: porque( arctan( l1- l2d) ) = 11 + ( l1- l2)2d2--------√porque(arctan(eu1-eu2d))=11+(eu1-eu2)2d2 \cos\left(\arctan\left(\frac{l_1-l_2}{d}\right)\right) = \frac{1}{\sqrt{1 +...
Existe um algoritmo para reorganizar uma matriz na forma diagonal de bloco, dado que a matriz é de natureza diagonal de bloco, mas randomizada com uma escolha imprudente de base? Em particular, existem módulos python para
Sou aluno de doutorado em Computação Científica e, nos últimos meses, passei bastante tempo aprendendo Python e C ++ da maneira certa. Sinto que aprendi bem C ++ e posso usar o Python para fazer o que quero, se mantiver um bom livro de referência. Eu também conheço o MATLAB o suficiente para...
Estou tentando reimplementar redes neurais em Python. Eu implementei a função de custo e o algoritmo de retropropagação corretamente. Eu os verifiquei executando seu código equivalente do Octave. Mas quando estou tentando usar a scipy.optimize.fmin_cgfunção, as iterações levam muito tempo para...
Quero acelerar meu programa python usando cython, mas meu loop interno ainda está fazendo chamadas lentas de python para o gerador de números aleatórios! Vários anos atrás, esse mesmo problema foi levantado por alguém que apoiava os sábios e parecia não haver uma boa solução naquele momento. Não é...
Quero resolver a equação isotérmica de Lane-Emden [PDF, eq. 15.2.9] d2ψdξ2+2ξdψdξ=e−ψd2ψdξ2+2ξdψdξ=e−ψ\frac{d^2 \!\psi}{d \xi^2} + \frac{2}{\xi} \frac{d \psi}{d \xi} = e^{-\psi} com as condições iniciais ψ(ξ=0)=0dψdξ∣∣∣ξ=0=0ψ(ξ=0)=0dψdξ|ξ=0=0\psi(\xi = 0) = 0 \quad \left.\frac{d\psi}{d...
Estou recebendo o aviso no assunto da postagem ao tentar otimizar uma função no Python com a função scipy.optimize.fmin_bfgs . A saída completa: Aviso: Erro desejado não necessariamente alcançado devido à perda de precisão Current function value: nan Iterations: 1 Function evaluations: 18...
Eu criei um spline para ajustar meus dados em python usando: spline=scipy.interpolate.UnivariateSpline(energy, fpp, k=4) A equação que quero usar envolve um somatório entre n = 2 en = infinito, onde n é a ordem do diferencial em um ponto Eo. No entanto, usando; UnivariateSpline.__call__(spline,...
Estou pensando em usar redes neurais artificiais (RNA) para prever as taxas de reação no meu fluido, em vez de resolver o sistema completo de ODEs rígidas. Algumas pessoas do meu laboratório já fizeram algum trabalho para não começar do zero, mas estou tendo problemas com meus aplicativos. Acho que...