Por que o yum não instala atualizações?

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Estou recebendo erros, acho que com o coreutils, onde o yum não será atualizado. Aqui está uma saída simplificada do que vejo quando executo yum update:

Resolving Dependencies
There are unfinished transactions remaining. You might consider running yum-complete-transaction first to finish them.
The program yum-complete-transaction is found in the yum-utils package.
--> Running transaction check
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.el6 will be updated
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.1.el6 will be an update
... more of the same, and then:
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
... then more of the same    --> Finished Dependency Resolution
--> Running transaction check
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64
---> Package kernel.x86_64 0:2.6.32-431.17.1.el6 will be erased
--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
           Requires: coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Removing: coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
               coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Updated By: coreutils-8.4-37.el6.x86_64 (base)
               coreutils = 8.4-37.el6
 You could try using --skip-broken to work around the problem
** Found 71 pre-existing rpmdb problem(s), 'yum check' output follows:
audit-libs-2.3.7-5.el6.x86_64 is a duplicate with audit-libs-2.2-4.el6_5.x86_64
audit-libs-python-2.3.7-5.el6.x86_64 is a duplicate with audit-libs-python-2.2-4.el6_5.x86_64
... then lots more like the above duplicate

Eu tenho outro servidor que é (quase) idêntico a isso (eles são com balanceamento de carga e funcionam com a mesma imagem) e esse não tem o mesmo problema. Qual pode ser o problema e como devo proceder da melhor maneira?

Atualizar:

Também executei yum-complete-transactiona falha e disse que havia renomeado os arquivos de transação. Ele ainda diz que há uma transação incompleta, mas agora isso acontece quando eu a executo:

[root@nico ~]# yum-complete-transaction
Loaded plugins: fastestmirror
Loading mirror speeds from cached hostfile
 * webtatic: uk.repo.webtatic.com
drivesrvr                                                                                                                                                                                                                                |  951 B     00:00
There are 1 outstanding transactions to complete. Finishing the most recent one
The remaining transaction had 252 elements left to run
... lots of:
Package name-1.23.x8x_64 already installed and latest version
...
--> Running transaction check
... lots of entries like this:
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.el6 will be updated
... and this:
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.1.el6 will be an update
... and this:
---> Package audit-libs.x86_64 0:2.2-4.el6_5 will be erased
Killed

De repente, ele pára com a Killedlinha.

Eu tentei correr a yum update --skip-brokenseguir:

[root@nico ~]# yum update --skip-broken
Freeing read locks for locker 0x7d: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x7f: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x80: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x81: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x82: 28940/139976145426176
Loaded plugins: downloadonly, fastestmirror, replace
Setting up Update Process
Loading mirror speeds from cached hostfile
 * webtatic: uk.repo.webtatic.com
drivesrvr                                                                                                                                                                                                                                |  951 B     00:00
Resolving Dependencies
There are unfinished transactions remaining. You might consider running yum-complete-transaction first to finish them.
--> Running transaction check
... lots of will be updated/will be an update/etc, then:
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64

Em seguida, vários outros Running transaction check:s, e Processing Dependency: coreutils =...entradas entre mais willy be updated/willbe an updateentradas. Então:

Packages skipped because of dependency problems:
    coreutils-8.4-37.el6.x86_64 from base

Dependencies Resolved

Em seguida, é mostrada uma tabela com uma lista de Installing:e Updating:pacotes, com um resumo no final:

Install       2 Package(s)
Upgrade      79 Package(s)
Remove        1 Package(s)

Em seguida, ele baixa todos os pacotes (81/81 com sucesso) e finalmente mostra o seguinte:

Total                                                                                                                                                                                                                           3.0 MB/s | 115 MB     00:37
Running rpm_check_debug
Killed

Atualização 2:

Também corri yum clean alle tive alguns problemas por lá também. Encontrei alguns conselhos para remover os __db*arquivos e tente novamente:

[root@nico ~]# yum clean all
rpmdb: Thread/process 29404/139880514733824 failed: Thread died in Berkeley DB library
error: db3 error(-30974) from dbenv->failchk: DB_RUNRECOVERY: Fatal error, run database recovery
error: cannot open Packages index using db3 -  (-30974)
error: cannot open Packages database in /var/lib/rpm
CRITICAL:yum.main:

Error: rpmdb open failed
[root@nico ~]# rm -f /var/lib/rpm/__db*
[root@nico ~]# yum clean all
Loaded plugins: downloadonly, fastestmirror, replace
Cleaning repos: base drivesrvr epel extras ius newrelic percona-release-noarch percona-release-x86_64 rackspace updates webtatic
Cleaning up Everything
Cleaning up list of fastest mirrors
[root@nico ~]# yum clean all
Loaded plugins: downloadonly, fastestmirror, replace
Cleaning repos: base drivesrvr epel extras ius newrelic percona-release-noarch percona-release-x86_64 rackspace updates webtatic
Cleaning up Everything
[root@nico ~]#

Atualização 3:

Eu segui /var/log/messagese vi muita produção quando corri yum-complete-transaction, cujas últimas duas linhas foram:

Nov 14 08:19:47 nico kernel: Out of memory: Kill process 30995 (yum-complete-tr) score 149 or sacrifice child
Nov 14 08:19:47 nico kernel: Killed process 30995, UID 0, (yum-complete-tr) total-vm:641952kB, anon-rss:181420kB, file-rss:4kB

Então, presumivelmente, isso sugere que esteja relacionado à memória. Em caso afirmativo, esse é um caso de precisar de mais RAM ou pode haver outro problema que preciso investigar?

Leonard Challis
fonte
2
Você verificou os logs do sistema? Você pode estar ficando sem memória.
Michael Hampton
Sim, acabei de atualizar a pergunta (atualização 3) com informações de memória, acho que você está certo.
Leonard Challis

Respostas:

6

Problema semelhante - e minha correção. Também tive um problema com a memória, então tive que atualizar a memória do VPS. Fiz uma atualização do yum - é claro que obtive os erros acima. Então olhei para o fracasso e percebi o que aconteceu: o Yum instalou (bem, começou a instalar) os mais recentes coreutils - versão 37, enquanto eu ainda tinha bits 31. Então, primeiro, removi a versão 37, depois limpei e executei o yum update novamente.

Isso fez com que a versão '31' estivesse disponível para ser "atualizada" corretamente. Veja o trabalho abaixo:

--> Running transaction check
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
           Requires: coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Removing: coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
               coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Updated By: coreutils-8.4-37.el6.x86_64 (base)
               coreutils = 8.4-37.el6
 You could try using --skip-broken to work around the problem

Em execução yum remove coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64:

Loaded plugins: fastestmirror
Setting up Remove Process
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6 will be erased
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved
==============================
========================================================================================

Package                         Arch                    Version                    Repository                  Size
======================================================================================================================
Removing:
 coreutils-libs                  x86_64                  8.4-37.el6                  installed                  5.4 k

Transaction Summary
======================================================================================================================
Remove        1 Package(s)

Installed size: 5.4 k
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
  Erasing    : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   1/1 
  Verifying  : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   1/1 

Removed:
  coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6                                                                                  

Complete!

Limpando usando yum clean all:

Loaded plugins: fastestmirror
Cleaning repos: base extras updates
Cleaning up Everything
Cleaning up list of fastest mirrors

Fazendo atualização da lista de pacotes yum update:

Loaded plugins: fastestmirror
Setting up Update Process
Determining fastest mirrors
 * base: mirrors.lga7.us.voxel.net
 * extras: mirrors.lga7.us.voxel.net
 * updates: mirror.cc.columbia.edu
base                                                                                           | 3.7 kB     00:00     
base/primary_db                                                                                | 4.6 MB     00:00     
extras                                                                                         | 3.4 kB     00:00     
extras/primary_db                                                                              |  30 kB     00:00     
updates                                                                                        | 3.4 kB     00:00     
updates/primary_db                                                                             | 1.5 MB     00:00     
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
---> Package coreutils-libs.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
---> Package coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved

======================================================================================================================
 Package                          Arch                     Version                       Repository              Size
======================================================================================================================
Updating:
 coreutils                        x86_64                   8.4-37.el6                    base                   3.0 M
 coreutils-libs                   x86_64                   8.4-37.el6                    base                    50 k

Transaction Summary
======================================================================================================================
Upgrade       2 Package(s)

Total download size: 3.1 M
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
(1/2): coreutils-8.4-37.el6.x86_64.rpm                                                         | 3.0 MB     00:00     
(2/2): coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64.rpm                                                    |  50 kB     00:00     
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Total                                                                                  44 MB/s | 3.1 MB     00:00     
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
  Updating   : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   1/4 
  Updating   : coreutils-8.4-37.el6.x86_64                                                                        2/4 
  Cleanup    : coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                               3/4 
  Cleanup    : coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                                    4/4 
  Verifying  : coreutils-8.4-37.el6.x86_64                                                                        1/4 
  Verifying  : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   2/4 
  Verifying  : coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                               3/4 
  Verifying  : coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                                    4/4 

Updated:
  coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6                           coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6                          

Complete!

-Sup.

John
fonte
10

O motivo usual para yummorrer Killedé que o sistema ficou sem memória.

Nos seus logs, parece que você tem uma instância do Amazon t1.micro, ou algo com o mesmo tamanho e sem espaço de troca. Essa quantidade restrita de memória geralmente não é suficiente para concluir um grande número de instalações / atualizações de pacotes.

Para resolver o problema:

  1. Encerre os serviços em execução até ter memória suficiente para concluir a transação yum.

    Ou...

  2. Adicione um arquivo de troca ou troca no armazenamento efêmero à sua instância.

Então você poderá concluir suas transações yum.


Por fim, para limpar os problemas do seu pacote com base nas atualizações anteriores com falha, tente

package-cleanup --cleandupes

antes de executar outras atualizações.

Michael Hampton
fonte
1
Você também pode aproveitar esta oportunidade para mudar para uma instância t2.micro, que possui mais memória, geralmente é mais rápida e mais barata.
Michael Hampton
Obrigado. Demorou para parar o httpd, mas está tudo funcionado e limpo depois também.
Leonard Challis
2

Tente you update --skip-brokenevitar os pacotes quebrados (você pode lidar com eles mais tarde), provavelmente uma boa ideia para executar yum clean allantes de fazer qualquer coisa.

alexus
fonte
1

Filtrar as informações estranhas que você citou e no meio yumjá tenta ajudá-lo:

Existem transações inacabadas restantes. Você pode considerar executar yum-complete-transactionprimeiro para finalizá-los. O programa yum-complete-transaction é encontrado no pacote yum-utils.

Você já tentou isso?

HBruijn
fonte
Sim, na verdade eu fiz. Ele me que não podia completa contada e tinha renomeado os arquivos de transação
Leonard Challis
Eu adicionei mais detalhes à pergunta com exemplos de quando as coisas estão falhando.
Leonard Challis
0

Experimente um

yum downgrade packagename

Não sei por que, mas é atualizado, ou pelo menos o fez com o pacote tcpdump. Fui da versão tcpdump-4.5.1-2.el7.x86_64 para tcpdump-4.7.4-1_ESG_ring.x86_64, que é o que eu queria.

hokie1999
fonte