Além do gnuplot e do ggobi , que ferramentas de código aberto as pessoas estão usando para visualizar dados multidimensionais?
O Gnuplot é mais ou menos um pacote básico de plotagem.
O Ggobi pode fazer várias coisas bacanas, como:
- animar dados ao longo de uma dimensão ou entre coleções discretas
- animar combinações lineares variando os coeficientes
- calcular componentes principais e outras transformações
- visualize e gire clusters de dados tridimensionais
- use cores para representar uma dimensão diferente
Que outras abordagens úteis são baseadas em código aberto e, portanto, livremente reutilizáveis ou personalizáveis?
Forneça uma breve descrição das habilidades do pacote na resposta.
data-visualization
open-source
user87
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Respostas:
Que tal R com ggplot2 ?
Outras ferramentas que eu realmente gosto:
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O pacote de treliça em R.
Quick-R tem uma introdução rápida .
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O ggobi e os links R para Ggobi são realmente bons para isso. Existem visualizações mais simples (iPlots é muito bom, também interativo, como mencionado).
Mas depende se você está fazendo algo mais especializado. Por exemplo, o TreeView permite visualizar o tipo de dendrograma de cluster obtido dos microarranjos.
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Matplotlib do Python
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Os pontos de vista são úteis para conjuntos de dados multivariáveis.
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O t-SNE possui muitas implementações de código aberto . Um dos mais fáceis de usar é provavelmente
sklearn.manifold.TSNE
.sklearn.manifold
contém outros métodos de aprendizado múltiplo para plotar seus dados em 2D:fonte
Veja também a biblioteca de plotagem de dados SCaVis . Funciona em qualquer plataforma desde Java. Ele suporta muitos contêineres de dados e estilos de plotagem (2D, 3D etc.)
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