Estou tentando entender e saber o que relatar da minha análise de alguns dados usando a média do modelo em R.
Estou usando o script a seguir para analisar o efeito do método de medição sobre uma determinada variável: Aqui está o conjunto de dados: https://www.dropbox.com/s/u9un273gzw9o30u/VMT4.csv?dl=0
Modelo a ser montado:
LM.1 <- gls(VMTf ~ turn+sex+method, na.action="na.fail", method = "ML",VMT4)
draga modelo completo
require(MuMIn)
d=dredge(LM.1)
print(d)
coefficients(d)
Obtenha informações resumidas de todos os modelos para obter estimativas de parâmetros
summary(model.avg(d))
Eu sei que todos os modelos podem ter média (média do modelo completo) ou apenas um subconjunto deles (média condicional). Agora, eu gostaria de saber: quando é melhor usar a média completa ou condicional para fazer inferências. O que devo relatar sobre tudo isso para um artigo científico? O que significa exatamente o valor Z e p associado a uma situação de média do modelo?
Para facilitar a visualização de minhas perguntas. Aqui está a tabela de resultados,
> summary(model.avg(d))# now, there are effects
Call:
model.avg(object = d)
Component model call:
gls(model = VMT ~ <8 unique rhs>, data = VMT4, method = ML, na.action =
na.fail)
Component models:
df logLik AICc delta weight
1 4 -247.10 502.52 0.00 0.34
12 5 -246.17 502.83 0.31 0.29
13 5 -246.52 503.52 1.01 0.20
123 6 -245.60 503.88 1.36 0.17
(Null) 2 -258.62 521.33 18.81 0.00
3 3 -258.38 522.95 20.43 0.00
2 3 -258.60 523.39 20.88 0.00
23 4 -258.36 525.05 22.53 0.00
Term codes:
method sex turn
1 2 3
Model-averaged coefficients:
(full average)
Estimate Std. Error Adjusted SE z value Pr(>|z|)
(Intercept) 42.63521 0.37170 0.37447 113.856 < 2e-16 ***
methodlight chamber -1.05276 0.36098 0.36440 2.889 0.00386 **
methodthermal gradient -1.80567 0.36103 0.36445 4.955 7e-07 ***
sex2 0.19023 0.29403 0.29548 0.644 0.51970
turn 0.05005 0.10083 0.10141 0.494 0.62165
(conditional average)
Estimate Std. Error Adjusted SE z value Pr(>|z|)
(Intercept) 42.6352 0.3717 0.3745 113.856 < 2e-16 ***
methodlight chamber -1.0528 0.3609 0.3643 2.890 0.00386 **
methodthermal gradient -1.8058 0.3608 0.3642 4.958 7.1e-07 ***
sex2 0.4144 0.3089 0.3119 1.328 0.18402
turn 0.1337 0.1264 0.1276 1.047 0.29492
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
Relative variable importance:
method sex turn
Importance: 1.00 0.46 0.37
N containing models: 4 4 4
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Penso que a premissa sobre a diferença entre o que exatamente são as médias completas e condicionais está errada. Um é uma média que inclui zeros (completo) e um não inclui zeros (condicional). do arquivo de ajuda para o comando model.avg ():
Se você deseja usar apenas um subconjunto de modelos (com base no delta AIC, por exemplo), use o argumento de subconjunto em model.avg (). Você ainda obterá estimativas condicionais e completas, desde que alguns dos modelos incluídos tenham algumas variáveis ausentes.
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