Quando o GIMP me permitirá salvar (não exportar) .jpg, .png etc.? Não por que não, apenas me diga quando. Ter que exportar as extensões de arquivo gráfico mais comuns no mundo é Jejune.
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Semanticamente, "exportar" e "salvar como" são (aproximadamente) a mesma coisa. Alguns programas (como o Photoshop) usam "salvar como", outros (como o GIMP) dizem "exportar". Mas eles efetivamente fazem a mesma coisa: salve em um formato não nativo.
Provavelmente nunca, pois essa foi uma alteração feita na 2.8 para evitar formatos destrutivos nos quais você pode salvar seu projeto (para não perder suas camadas).
Você pode trocar o atalho "exportar como" (Ctrl + Shift + E) pelo "salvar como" (Ctrl + Shift + S) se isso o incomodar.