Minha situação:
- Win7 instalado de 64 bits
- TrueCrypt 7.0 instalado
- Nas preferências, o AES acelerado por hardware ativado (faz com que o TrueCrypt use ciclos de CPU negligenciáveis)
- Instruiu o TrueCrypt a criptografar toda a unidade do sistema
- Na inicialização, você agora recebe um gerenciador de inicialização solicitando a senha e, inicialmente, uma verificação em segundo plano que criptografa tudo. Depois disso, é apenas transparente fazê-lo em segundo plano
Agora, alguns meses após a execução dessa configuração, sua pergunta me deixou curiosa, pois eu gostaria de fazê-lo também, fiz o seguinte:
- Ubunto inicializado de 64 bits a partir de um CD ao vivo
- TrueCrypt instalado
- Montei meu HD, mas escolha sda2 na caixa de diálogo do dispositivo e marque a caixa de seleção "Montar partição usando criptografia do sistema (autenticação pré-inicialização)"
- Naveguei no Ubuntu Explorer
Para que eu possa confirmar que você pode fazer o que deseja, siga as etapas acima. Além disso, como FYI, estou muito feliz com a configuração acima