Posso ver perguntas perguntando como impedir que o Windows Update ( solicite ) reinicie o computador , mas não vejo uma perguntando como impedir que ele mantenha um backup para uma possível desinstalação posteriormente. Sei que é possível fazer isso manualmente via opção de linha de comando, se um baixar e instalar a atualização fora do Windows Update, por isso presumo que seja possível definir algum registro para impedi-lo também para o Windows Update?
Windows XP
A TI seria uma maneira mais segura de permitir que as informações de desinstalação sejam salvas para iniciantes e, depois que a instalação for bem-sucedida, remova as informações de desinstalação.
Esta postagem do blog possui um script para essas limpezas - remover as informações de desinstalação do Windows Update .
Testado no Windows XP, requer WScript e VBScript (que seria na maioria dos sistemas operacionais Windows)
Você não diz qual versão do Windows está falando (se você está perguntando sobre uma versão específica).
No Vista, a atualização do Windows usa os Pontos de Restauração do Sistema - ele cria um antes de instalar as atualizações (até de maneira irritante, as atualizações de padrões do Windows Defender).
Você pode impedir que o Windows Installer faça Pontos de Restauração do Sistema, definindo (ou criando) a chave do Registro HKLM \ SOFTWARE \ Policies \ Microsoft \ Windows \ Installer \ LimitSystemRestoreCheckpointing com o valor 1.
Uma maneira mais clara de fazer isso no Business e Ultimate é executar o gpedit.msc e, em Configuração do Computador, Modelos Administrativos, Componentes do Windows, Windows Installer, clique duas vezes em "Desativar a criação dos Pontos de Verificação de Restauração do Sistema" e defina-o como Ativado.
Esteja ciente de que isso desabilitaria a criação do ponto de restauração do sistema para TODAS as instalações de software, não apenas as atualizações do Windows.
Não conheço nenhuma maneira de alterar o comportamento do Windows Update.