Um recurso pouco conhecido do servidor X no Linux e em outros sistemas operacionais semelhantes ao UNIX leva você até a metade do caminho.
Qualquer coisa que você destaque no Linux, independentemente do programa, é colocada em um buffer especial da área de transferência, que você pode colar usando o botão do meio do mouse (roda) (que é emulado em muitos laptops pressionando os dois botões ao mesmo tempo). Você também pode usar um atalho de teclado, se quiser.
Infelizmente, acho que você não pode alterar gnome-terminal
o comportamento do botão direito do mouse.