Devo formatar pen drives e cartões SD para FAT, FAT32, exFAT ou NTFS? (Arquivos do Windows, distribuições Linux ao vivo)

Depende do tamanho da mídia qual escolher ou de alguns outros parâmetros? No Windows 7, o FAT16 é o padrão. No instalador USB universal da pendrivelinux.com, FAT32. Qual devo escolher? E quanto ao NTFS para Windows?

E o exFAT ? É o sistema de arquivos projetado pela Microsoft para mídia removível. Existe alguma diferença entre pen drives e cartões SD a esse respeito?

Vendo os desenvolvimentos na outra pergunta , ainda devo usar algo como exFAT se não quiser que as lixeiras sejam criadas em todas as máquinas nas quais conecto meu pen drive USB?

Simplificando:

• Entre FAT e FAT32, basta escolher FAT32.
• Entre NTFS e FAT32, se você usar a unidade apenas no Windows, use NTFS. Em qualquer outro caso, use FAT32.

Por que NTFS para Windows?

• O NTFS (New Technology File System) foi introduzido pelo Windows e é suportado desde as primeiras versões do Windows. Então isso se tornou uma coisa do Windows.

• É o sistema de arquivos nativo para Windows NT, Windows 2000 e Windows XP.

• Permite a indexação, o que melhora a pesquisa de arquivos (principalmente, mais rápido); causa um leve impacto no desempenho (pode desligar).
• Possui melhor segurança - como criptografia em arquivos (não suportada pelo Windows XP Home edition) e regras de acesso por usuário (você pode impedir que sua esposa veja a pasta pornô!)
• Suporta cotas de usuários (impede que os tykes baixem muitos arquivos MP3)
• Possui compactação em arquivos.
• É registrado no diário, diminuindo a perda de dados (o ScanDisk na inicialização é desnecessário).
• Usa nomes de arquivo Unicode (permite caracteres externos e estendidos) e suporta nativamente nomes de arquivos longos.
• Suporta arquivos maiores que o FAT (maior que 4 GB).
• Permite tamanhos de volume maiores (maiores que 1 TB). Fala-se de um limite teórico de 16 exabytes e até 2 terabytes.
• Formato suportado em discos dinâmicos (sem discos dinâmicos no Windows XP Home).
• Funciona bem com cache grande (sistemas com mais de 96 MB).
• Apresenta melhor desempenho em volumes ~ 20 GB e mais.
• É mais eficiente em termos de espaço em grandes volumes (maiores que 8 GB).
• Resistente à fragmentação.

Por que o FAT32 para Linux?

• O FAT32 funciona bem em quase todos os lugares. [O FAT32 nem é o sistema de arquivos padrão no Linux (ao contrário de NTFS e Windows)]

O Windows formata as unidades USB como NTFS por padrão, o FAT é realmente antigo e o tipo de sistema de arquivos que você deseja usar depende da sua necessidade.

NTFS

• Suporta arquivos maiores que 4 GB
• Pode executar o Windows 8 ao vivo
• O UNetbootin não oferece suporte a NTFS e se recusa a usar unidades formatadas em NTFS.

FAT32

• Os arquivos devem ter menos de 4 GB
• Linux Live funciona

Saiba que você pode ter várias partições no seu dispositivo USB e, portanto, pode ter uma partição NTFS e FAT32.

Eu recomendo usar o UDF , que tem aproximadamente as mesmas vantagens que o NTFS mencionado na resposta do @ Hele. O maior motivo para usar UDF em vez de NTFS é a compatibilidade com o OS X. O OS X pode apenas ler, mas não gravar, em partições NTFS. O UDF é bem suportado, leitura e gravação, no Windows®, OS X e Linux.

Para formatar uma unidade como UDF, consulte:

• Usando UDF em uma unidade flash USB
• Como formatar uma unidade flash como UDF no Windows 7?

Cept Exceto Windows XP, que possui suporte UDF somente leitura

NTFS e exFAT são mais rápidos que FAT32 na memória flash.

Referência: Resultados de Benchmark: Iometer 4 KB Random And Streaming Read / Write