A pergunta praticamente se sustenta.
Para apenas clicar com o botão direito sempre em cima e ter a janela em foco o tempo todo. (em cima de outras janelas, não importa se você clicar em outro lugar, na área de trabalho, na barra de tarefas, no explorer etc.). Alguma ferramenta útil ou alguma outra sugestão.
O Windows 7 não pode fazer isso. Mas você pode fazer isso com a ajuda de um programa chamado Dexpot . Vá e faça o download do Dexpot, que é realmente um programa para desktops virtuais. Depois de baixar o programa, clique com o botão direito do mouse em uma janela, selecione Dexpot e escolha sempre no topo. Há também uma opção para tornar uma janela transparente.
Aqui, uma captura de tela:
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