Eu nem mesmo instalo python. E depois que eu apagar, ele aparecerá depois de um tempo. Então eu acho que foi criado por algumas outras aplicações. Alguém encontrou o mesmo problema e sabe por quê?
Além disso, aqui está a estrutura do arquivo da pasta:
- .matplotlib
- tex.cache (pasta vazia)
- fontList.cache
E aqui estão os programas que eu instalei: 
windows-8.1
home-folder
matplotlib
Elderry
fonte
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Você pode postar uma lista de programas que você instalou no computador? Um deles pode requerer matplotlib e python e automaticamente (re) instalá-lo.
K.A
Você instalou algum tipo de coisa integrada no shell? Isso soa como o tipo de coisa que ocorre quando eu instalo o Tortoise SVN, ou o material do Git, etc. A instalação do Python pode ter instalado uma extensão de shell similar e simplesmente excluir a pasta Python não seria suficiente para removê-la. Se você baixar e usar o Autoruns.exe ou similar, poderá ver e desativar as extensões instaladas.
Mark Allen