Nota: Eu trabalho para a Fundação Yorba e sou o principal desenvolvedor da Shotwell. A seguir, minhas próprias opiniões e observações.
Quando o Ubuntu nos abordou pela primeira vez sobre como fazer do Shotwell o gerenciador de fotos padrão, sugerimos que o Shotwell não substituísse o EoG como visualizador de fotos individual. Naquela época, o visualizador de fotos da Shotwell não possuía muitos recursos significativos que a EoG oferecia, incluindo panorâmica e zoom e uma exibição em miniatura de todas as imagens no diretório atual. O visualizador de metadados do EoG (Imagem -> Propriedades) também é mais completo que o do Shotwell.
Dito isto, estamos constantemente buscando melhorar o Shotwell e todos esses itens que mencionei estão programados para inclusão em algum momento. (O zoom panorâmico foi adicionado desde a decisão do Ubuntu.) Se o Shotwell tivesse uma exibição de faixas em miniatura (ou até uma barra lateral listando todos os arquivos em um diretório), eu me sentiria confortável em recomendá-lo como um visualizador de fotos padrão - mas isso é uma decisão para a distribuição, não eu.
Acho que o Shotwell é mais um aplicativo completo de gerenciamento de fotos do que um simples visualizador de imagens como o EOG.
É por isso que a declaração oficial do ubuntu fala sobre isso como um substituto para o F-Spot.
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Isso não responde exatamente à sua pergunta, mas você pode alterar o visualizador padrão.
Se você clicar com o botão direito do mouse na imagem, selecione "Abrir com" e depois "Outra aplicação ...", deixando 'Lembrar esta aplicação para arquivos "JPEG Image"' marcada, encontre 'Shotwell Photo Viewer' e clique em "Abrir". defina o Shotwell Photo Viewer como o visualizador padrão.
Acho que o Shotwell Photo Viewer é mais rápido de abrir do que o EOG - que pode ser removido usando sua ferramenta favorita de gerenciamento de pacotes.
Quanto à diferença de recursos, não vejo diferença significativa.
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