Aqui está a minha solução:
Como reativar a lista branca de systray no Ubuntu 13.04 (Raring Ringtail)
Se você usa esse aplicativo e deseja a lista de permissões do systray de volta no Ubuntu 13.04, pode usar um PPA que acompanha o Unity corrigido para reativar a lista de permissões do systray. Para fazer isso, abra um terminal e execute os seguintes comandos:
sudo add-apt-repository ppa:timekiller/unity-systrayfix
sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade
Em seguida, reinicie o Unity pressionando ALT + F2
e digitando " unity
" ou saindo. Em seguida, abra o Dconf Editor , navegue até o painel com> canonical> unity> e a " lista branca de systray-whitelist " deve ser exibida lá para que você possa permitir que alguns aplicativos possam usar a systray.
Após adicionar um aplicativo à lista de permissões do systray, lembre-se de reiniciar o Unity, caso contrário não funcionará.
fonte: http://www.webupd8.org/2013/05/how-to-get-systray-whitelist-back-in.html