Depois de instalar a biblioteca geos (C ++ e C) e, em seguida, tentar instalar o pacote rgeos (R), ele reporta a falta de configuração do geos!

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Sabendo que o pacote rgeos, da linguagem R, requer uma instalação anterior das bibliotecas geos, instalei libgeos e libgeos-c1 (3.2.2), usando o instalador sináptico na minha máquina Ubuntu 12.04 (32 bits).

Tentei instalar o rgeos diretamente do console do R e ele emitiu uma mensagem no sentido de que o geos-config não foi encontrado. A saída é a seguinte:

> install.packages("rgeos")
Installing package(s) into ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependency ‘sp’

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/sp_1.0-9.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 882102 bytes (861 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 861 Kb

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/rgeos_0.2-19.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 221471 bytes (216 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 216 Kb

* installing *source* package ‘sp’ ...
** package ‘sp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c R    centroid.c -o Rcentroid.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c gcdist.c -o gcdist.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c init.c -o init.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip.c -o pip.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip2.c -o pip2.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c sp_xports.c -o sp_xports.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c surfaceArea.c -o surfaceArea.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c zerodist.c -o zerodist.o
gcc -std=gnu99 -shared -o sp.so Rcentroid.o gcdist.o init.o pip.o pip2.o sp_xports.o surfaceArea.o zerodist.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/sp/libs
** R
** data
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   ‘intro_sp.Rnw’ 
   ‘over.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded

* DONE (sp)
* installing *source* package ‘rgeos’ ...
** package ‘rgeos’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: gcc -std=gnu99
configure: CXX: g++
configure: rgeos: 0.2-17
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 394
checking geos-config usability... 
./configure: line 1385: geos-config: command not found
no
configure: error: geos-config not usable
ERROR: configuration failed for package ‘rgeos’
* removing ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/rgeos’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rgeos’ had non-zero exit status

Perdoe minha ignorância, mas não sei de onde vem esse arquivo "geos-config": ele deve ser gerado pelas compilações do gcc acima ou deve ser instalado anteriormente quando as bibliotecas do libgeos foram instaladas?

Aprendi, em outra máquina, que "geos-config" é um executável e que deve ser instalado em / usr / bin.

Você tem alguma idéia do que há de errado com meu procedimento?

Obrigado,

-Sérgio.

JulioSergio
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Respostas:

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Instale o pacote libgeos-devInstale o libgeos-dev com seu gerenciador de pacotes favorito (ou centro de software) e você terá /usr/bin/geos-config.

Como eu encontrei isso? Eu usei a consulta geos-configde arquivos na página http://packages.ubuntu.com/ . Isso listará o pacote que você precisa ( link de consulta ). Use isso da próxima vez quando tiver problemas semelhantes!

gertvdijk
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Você também pode usar a boa ferramenta apt-filepara procurar arquivos no repositório ubuntu. Por exemplo. apt-file search geos-configfornecerá uma correspondência exata para libgeos-dev.
ortang
Obrigado! Fiz como você recomendou, e o pacote R "rgeos" também foi instalado sem problemas.
JulioSergio
2

Como o OP não nomeia uma distribuição específica, eis a linha que eu precisava para instalar o go-config no CENTOS (por exemplo, RHEL e Amazon Linux): yum install -y geos-devel

D. Woods
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