O atalho Alt-F4 envie uma mensagem de fechamento para a janela, como quando você pressiona o pequeno botão x na barra de título. É uma configuração do gerenciador de janelas.
Depende do aplicativo responder ou não a esse evento, fechando todos juntos o aplicativo ou iconizando (por exemplo, como o xchat pode ser configurado) ou outro.
O atalho Ctrl- que Qvocê mencionou não é universal; todo aplicativo pode ter seu próprio. Por exemplo, evince
use Ctrl- W, algum outro uso Ctrl- Qpara fechar, Ctrl- Wpara fechar uma única guia e Shift- Ctrl- Wpara fechar todas as guias (mas não todas as janelas).
hiding
significaminimize
, deixando-o funcionando onde você usa os botões da janela no painel para recuperá-lo; O fechamento também o remove do painel. (nota: tecnicamente Unity não tem painel mais;))