Por que o kernel do Linux mata processos quando tem 14 GB de memória livre e como corrigi-lo?

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Saída de freemostrou que meus aplicativos usam apenas 2GB, swap não foi usado. No entanto, meus aplicativos estavam sendo eliminados (Skype, Firefox, Thunderbird). Eu assisti htope parecia que eles alocaram alguns megabytes e foram mortos. Eu tive que reiniciar para "corrigir" o problema.

Minha pergunta é por que e mais importante, como corrigi-lo quando isso acontecer novamente (quero dizer, além de reiniciar)? (EDIT3)

Foi muito chato, perdi um longo post (o Firefox foi morto sem aviso prévio) e outras coisas. É normal no Linux matar aplicativos b / c OOM com 80% de memória livre e sem nenhuma tentativa de usar swap?

EDIT: A distribuição é o Kubuntu 16.04.

EDIT2: Log (pequeno fragmento, b / c do limite de comprimento do post):

[ 2687.946164] Xorg invoked oom-killer: gfp_mask=0x24040c0, order=3, oom_score_adj=0
[ 2687.946167] Xorg cpuset=/ mems_allowed=0
[ 2687.946171] CPU: 3 PID: 2109 Comm: Xorg Tainted: P           OE   4.4.0-59-generic #80-Ubuntu
[ 2687.946172] Hardware name: MSI MS-7850/B85-G41 PC Mate(MS-7850), BIOS V2.9 03/30/2015
[ 2687.946174]  0000000000000286 00000000828bbbc2 ffff880409ad38d8 ffffffff813f7583
[ 2687.946176]  ffff880409ad3ab0 ffff880392c09c00 ffff880409ad3948 ffffffff8120ad5e
[ 2687.946177]  0000000000000015 0000000000000000 ffff8802e4f47180 ffff8800033c2a00
[ 2687.946179] Call Trace:
...
[ 2687.946394] Mem-Info:
[ 2687.946396] active_anon:720752 inactive_anon:279235 isolated_anon:0
[ 2687.946396]  active_file:729283 inactive_file:2048755 isolated_file:0
[ 2687.946396]  unevictable:24 dirty:34175 writeback:29190 unstable:0
[ 2687.946396]  slab_reclaimable:107795 slab_unreclaimable:37549
[ 2687.946396]  mapped:269800 shmem:51809 pagetables:15581 bounce:0
[ 2687.946396]  free:38642 free_pcp:46 free_cma:0
[ 2687.946398] Node 0 DMA free:15900kB min:64kB low:80kB high:96kB active_anon:0kB inactive_anon:0kB active_file:0kB inactive_file:0kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:15984kB managed:15900kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:0kB shmem:0kB slab_reclaimable:0kB slab_unreclaimable:0kB kernel_stack:0kB pagetables:0kB unstable:0kB bounce:0kB free_pcp:0kB local_pcp:0kB free_cma:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? yes
[ 2687.946401] lowmem_reserve[]: 0 3401 15912 15912 15912
[ 2687.946403] Node 0 DMA32 free:69016kB min:14432kB low:18040kB high:21648kB active_anon:393040kB inactive_anon:463048kB active_file:635316kB inactive_file:1758444kB unevictable:80kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:3613072kB managed:3532452kB mlocked:80kB dirty:26300kB writeback:23864kB mapped:226516kB shmem:47828kB slab_reclaimable:91324kB slab_unreclaimable:56464kB kernel_stack:2704kB pagetables:13724kB unstable:0kB bounce:0kB free_pcp:0kB local_pcp:0kB free_cma:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? no
[ 2687.946406] lowmem_reserve[]: 0 0 12510 12510 12510
[ 2687.946408] Node 0 Normal free:69652kB min:53084kB low:66352kB high:79624kB active_anon:2489968kB inactive_anon:653892kB active_file:2281816kB inactive_file:6436576kB unevictable:16kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:13074432kB managed:12810984kB mlocked:16kB dirty:110400kB writeback:92896kB mapped:852684kB shmem:159408kB slab_reclaimable:339856kB slab_unreclaimable:93732kB kernel_stack:11072kB pagetables:48600kB unstable:0kB bounce:0kB free_pcp:172kB local_pcp:0kB free_cma:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:128 all_unreclaimable? no
[ 2687.946411] lowmem_reserve[]: 0 0 0 0 0
[ 2687.946412] Node 0 DMA: 1*4kB (U) 1*8kB (U) 1*16kB (U) 0*32kB 2*64kB (U) 1*128kB (U) 1*256kB (U) 0*512kB 1*1024kB (U) 1*2048kB (M) 3*4096kB (M) = 15900kB
[ 2687.946419] Node 0 DMA32: 6415*4kB (UME) 2655*8kB (UME) 1398*16kB (UME) 0*32kB 0*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 69268kB
[ 2687.946424] Node 0 Normal: 10812*4kB (ME) 2620*8kB (UM) 72*16kB (M) 0*32kB 0*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 1*4096kB (H) = 69456kB
[ 2687.946439] Node 0 hugepages_total=0 hugepages_free=0 hugepages_surp=0 hugepages_size=1048576kB
[ 2687.946440] Node 0 hugepages_total=0 hugepages_free=0 hugepages_surp=0 hugepages_size=2048kB
[ 2687.946441] 2829837 total pagecache pages
[ 2687.946442] 0 pages in swap cache
[ 2687.946443] Swap cache stats: add 0, delete 0, find 0/0
[ 2687.946443] Free swap  = 16699388kB
[ 2687.946444] Total swap = 16699388kB
[ 2687.946444] 4175872 pages RAM
[ 2687.946445] 0 pages HighMem/MovableOnly
[ 2687.946445] 86038 pages reserved
[ 2687.946446] 0 pages cma reserved
[ 2687.946446] 0 pages hwpoisoned
[ 2687.946447] [ pid ]   uid  tgid total_vm      rss nr_ptes nr_pmds swapents oom_score_adj name
[ 2687.946453] [  445]     0   445     8850     1198      20       3        0             0 systemd-journal
[ 2687.946454] [  478]     0   478    25742      381      17       3        0             0 lvmetad
[ 2687.946456] [  492]     0   492    11323     1100      23       3        0         -1000 systemd-udevd
[ 2687.946458] [ 1070]   100  1070    25596      640      21       3        0             0 systemd-timesyn
[ 2687.946459] [ 1112]     0  1112     1100      333       8       3        0             0 acpid
[ 2687.946461] [ 1116]     0  1116    41637     2192      36       3        0             0 thermald
[ 2687.946462] [ 1118]     0  1118     7280      757      19       3        0             0 cron
[ 2687.946463] [ 1120]   108  1120    91142     3432      78       3        0             0 whoopsie
[ 2687.946465] [ 1122]   106  1122    10949     1230      27       3        0          -900 dbus-daemon
[ 2687.946466] [ 1130]     0  1130     3964      622      14       3        0             0 anacron
[ 2687.946467] [ 1132]     0  1132   112330     4027      71       3        0             0 NetworkManager
[ 2687.946468] [ 1133]     0  1133    53957     4872      29       5        0             0 snapd
[ 2687.946470] [ 1165]     0  1165    84379     2173      66       3        0             0 ModemManager
[ 2687.946471] [ 1167]   104  1167    64099      871      27       3        0             0 rsyslogd
[ 2687.946472] [ 1168]   122  1168    33544     4711      53       3        0             0 freshclam
[ 2687.946473] [ 1170]   110  1170    11229      911      27       3        0             0 avahi-daemon
[ 2687.946475] [ 1174]     0  1174     7157      789      18       3        0             0 systemd-logind
[ 2687.946476] [ 1183]     0  1183    69059     2174      38       3        0             0 accounts-daemon
[ 2687.946477] [ 1224]   110  1224    11197       85      26       3        0             0 avahi-daemon
[ 2687.946479] [ 1270]     0  1270    70587     2236      41       3        0             0 polkitd
[ 2687.946480] [ 1299]   126  1299    73695     6057      71       4        0          -900 postgres
[ 2687.946481] [ 1302]   126  1302    73695     1019      58       4        0             0 postgres
[ 2687.946482] [ 1303]   126  1303    73695     1425      59       4        0             0 postgres
[ 2687.946483] [ 1304]   126  1304    73695     1019      57       4        0             0 postgres
[ 2687.946485] [ 1305]   126  1305    73802     1637      62       4        0             0 postgres
[ 2687.946486] [ 1306]   126  1306    37475      830      55       4        0             0 postgres
[ 2687.946487] [ 1680]     0  1680     4030      892      13       3        0             0 dhclient
[ 2687.946489] [ 1692] 65534  1692    13245     1056      31       3        0             0 dnsmasq
[ 2687.946490] [ 1971]     0  1971     4868      572      14       3        0             0 irqbalance
[ 2687.946491] [ 2027]   127  2027   940075   118111     325       7        0             0 java
[ 2687.946493] [ 2049]     0  2049    26294     3360      41       3        0             0 sddm
[ 2687.946494] [ 2099]     0  2099     5323      878      16       3        0             0 mysqld_safe
[ 2687.946495] [ 2107]     0  2107    27240     1164      53       3        0             0 sendmail-mta
[ 2687.946496] [ 2109]     0  2109    84298    54063     166       3        0             0 Xorg
[ 2687.946498] [ 2254]   129  2254   151112    24593      89       3        0             0 mysqld
[ 2687.946499] [ 2255]     0  2255     6551      344      18       3        0             0 logger
[ 2687.946500] [ 2278]   128  2278    54060     3442      52       4        0             0 murmurd
[ 2687.946502] [ 2299]     0  2299    60029     1474     113       4        0             0 nmbd
[ 2687.946503] [ 2312]   120  2312     4275      408      14       3        0             0 nvidia-persiste
[ 2687.946504] [ 2324]     0  2324    71846     2203     135       3        0             0 winbindd
[ 2687.946506] [ 2325]     0  2325    71844     2273     136       3        0             0 winbindd
[ 2687.946507] [ 2331]     0  2331    84508     3947     163       3        0             0 smbd
[ 2687.946508] [ 2332]     0  2332    82479     1147     152       3        0             0 smbd
[ 2687.946509] [ 2335]     0  2335    71845     1632     136       3        0             0 winbindd
[ 2687.946511] [ 2336]     0  2336    71845     1031     134       3        0             0 winbindd
[ 2687.946512] [ 2338]     0  2338    33686      884      60       3        0             0 veracrypt
[ 2687.946513] [ 2339]     0  2339    78817      875      69       3        0             0 veracrypt
[ 2687.946514] [ 2347]     0  2347    84508     1814     156       3        0             0 smbd
[ 2687.946516] [ 2478]     0  2478    31094     2925      52       3        0             0 sddm-helper
[ 2687.946517] [ 2490]  1000  2490    11345     1227      25       4        0             0 systemd
[ 2687.946518] [ 2491]  1000  2491    15954      614      34       3        0             0 (sd-pam)
[ 2687.946520] [ 2500]  1000  2500     1127      403       8       3        0             0 startkde
[ 2687.946521] [ 2578]     0  2578     7534     4948      18       3        0             0 mount.ntfs
[ 2687.946522] [ 2583]  1000  2583    41663      137      18       3        0             0 gpg-agent
[ 2687.946523] [ 2586]  1000  2586     2785       80       9       3        0             0 ssh-agent
[ 2687.946525] [ 2590]  1000  2590    10900      643      23       3        0             0 dbus-launch
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[ 2687.946635] [ 8552]   126  8552    73917     2022      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946636] [ 8554]   126  8554    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946637] [ 8556]   126  8556    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946639] [ 8559]   126  8559    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946640] [ 8560]   126  8560    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946641] [ 8562]   126  8562    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946642] [ 8643]   126  8643    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946644] [ 8645]   126  8645    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946645] [ 8648]   126  8648    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946646] [ 8649]   126  8649    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946647] [ 8652]   126  8652    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946648] [ 8653]   126  8653    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946649] [ 8656]   126  8656    73917     2038      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946650] [ 8657]   126  8657    73917     2036      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946652] [ 8659]   126  8659    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946653] [ 8661]   126  8661    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946654] [ 8663]   126  8663    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946655] [ 8665]   126  8665    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946656] [ 8667]   126  8667    73917     2051      63       4        0             0 postgres
[ 2687.946658] [ 9415]  1000  9415   135556    80527     253       2        0             0 steam
[ 2687.946659] [ 9417]  1000  9417    33897    13343      58       2        0             0 steam
[ 2687.946660] [ 9418]  1000  9418     1127      176       8       3        0             0 sh
[ 2687.946661] [ 9420]  1000  9420     3164      767      12       3        0             0 steamwebhelper.
[ 2687.946663] [ 9422]  1000  9422   151458    19771     193       5        0             0 steamwebhelper
[ 2687.946664] [ 9424]  1000  9424    78943     9566     131       4        0             0 steamwebhelper
[ 2687.946666] [ 9542]  1000  9542   232518    13239     162      25        0           300 steamwebhelper
[ 2687.946667] [ 9606]  1000  9606   233909    14334     165      26        0           300 steamwebhelper
[ 2687.946668] [ 9734]   111  9734    76055     3464      50       3        0             0 colord
[ 2687.946669] [10387]     0 10387    23345     1859      46       3        0             0 cupsd
[ 2687.946671] [10389]     7 10389    20311     1396      41       3        0             0 dbus
[ 2687.946672] [10390]     7 10390    20311     1441      43       3        0             0 dbus
[ 2687.946673] Out of memory: Kill process 3274 (skypeforlinux) score 305 or sacrifice child
[ 2687.946697] Killed process 3274 (skypeforlinux) total-vm:1252848kB, anon-rss:103412kB, file-rss:65424kB

Eu suspeito que ele tenha algo a ver com não liberar o cache io, infelizmente eu não salvei a saída do free.

EDIT3: Eu pensei que a pergunta em negrito estava claramente marcada, mas algumas pessoas não conseguiram ler e começaram a marcar todo esse post como "em espera, pois não está claro o que você está perguntando" . Forneci todas as informações solicitadas adicionais e, para ter certeza, o título editado é uma pergunta para evitar situações em que alguém ignora o texto da pergunta e o marca imediatamente como "claro o que é a pergunta" ...

EDIT4: Aconteceu novamente, definitivamente relacionado ao IO alto (leitura do HDD). Saída de free:

              total        used        free      shared  buff/cache   available
Mem:          15975        3535         294         151       12145       11867
Swap:         16307           1       16306
monnef
fonte
3
Você precisará fornecer a saída completa da mensagem do OOM killer. Isso não pode ser respondido sem isso.
Patrick
1
Estranho que o swap não seja usado ... você poderia adicionar a saída de cat /proc/sys/vm/swappiness.
Thomas
1
Bem, sua memória é extremamente fragmentada. seu DMA32 tem 0 páginas> = ordem = 3 e o normal apenas possui uma ordem = 12 partes (que podem ser divididas em partes menores, mas ainda significa que você está com falta). No entanto, gfp_maskisso indica que ele não solicitou especificamente a zona DMA32, portanto deve poder sair do normal.
Patrick
4
Por que isso está fechado "não está claro o que você está perguntando"? Há uma pergunta muito clara e não há solicitações pendentes para obter mais informações. A pergunta tem a mensagem oom killer, que deve ser mais que suficiente para descobrir isso.
Patrick Patrick
2
Eu não entendo por que as pessoas estão votando para fechar isso (eles estão lendo isso?). A caixa sobre "colocar em espera" não se aplica a esta pergunta - a pergunta está claramente definida (em negrito e agora até no título) e respondi a todas as solicitações de informações adicionais. Estou começando a pensar que stackexchange é um site ruim para fazer perguntas, e os rumores sobre estar cheio de trolls podem estar certos: - /.
monnef

Respostas:

2

Para suas perguntas:
Por que: Você provavelmente está usando o Kernel 4.4.0-59. Nesse caso, você é afetado por um bug do OOM: https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/linux/+bug/1655842 .
Como corrigi-lo quando isso acontecer novamente: Faça o downgrade do seu kernel para, por exemplo. 4.4.0-57.

Nicolas Bigler
fonte
Sim, estou usando essa versão (padrão) do kernel ( 4.4.0-59-generic). Vou tentar fazer o downgrade, obrigado pela sugestão.
monnef