Instalei recentemente o Centos e encontrei este arquivo e não sei o que ele faz e no diretório inicial todos os arquivos (Documentos, Downloads, fotos, vídeos) estão ausentes ou estão vazios
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É o arquivo de kickstart criado pelo instalador do anaconda com base nas configurações definidas.
Há uma descrição completa do RH:
O processo de instalação do Red Hat Enterprise Linux grava automaticamente um arquivo Kickstart que contém as configurações do sistema instalado. Este arquivo é sempre salvo como /root/anaconda-ks.cfg. Você pode usar esse arquivo para repetir a instalação com configurações idênticas ou modificar cópias para especificar configurações para outros sistemas.
Extraído de access.redhat.com/documentation