Acabei de adicionar um segundo monitor e me deparei com esse problema tão típico em que os monitores são trocados.
Aparentemente, o segundo monitor foi identificado como "monitor 0" pelo X.org, mas é o número 2 de acordo com o applet de configuração da ATI. (O applet numera os monitores começando com 1, e não 0.) Dito isto, este segundo monitor é o primeiro listado pelo applet.
Isso me preocupa, já que encontrei problemas no Windows com monitores duplos trocando aleatoriamente após a reinicialização. Mover os painéis do Gnome foi fácil, se não exatamente óbvio. No entanto, eu me pergunto sobre a possibilidade de outras coisas usarem o "monitor 0" quando, nesse caso, eu as esperaria no "monitor 1".
Então, posso controlar qual monitor é considerado primário?
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O OP fala sobre a placa ATI, então eu gostaria de sugerir uma alternativa específica para as placas NVidia, mas considero que a resposta aceita é mais genérica e funcionaria para ambos ...
Meus monitores têm diferentes resoluções máximas.
Eu obtive essas informações depois de usar nvidia-settings, configurar os monitores e tentar criar um arquivo conf xorg (mas não aplicá-lo, apenas lendo).
Após a inicialização, basta clicar no ícone da área de trabalho que criei para ativar uma dessas configurações.
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