Ok, isso é novo. Eu já vi casos como esse com dispositivos de armazenamento com defeito, com falhas no armazenamento remoto (SAN, NAS), acho que vi algo semelhante causado por permissões de montagem. Mas é a primeira vez que vejo isso acontecendo no mesmo sistema de arquivos que meu homedir...
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Permissões de diretório local do Linux como pontos de interrogação para não raiz