De acordo com a documentação da Cisco, diz
A configuração em execução que você edita em um modo de configuração ou que é usada nos comandos de cópia ou gravação depende da sua localização. Quando você está no espaço de execução do sistema, a configuração em execução consiste apenas na configuração do sistema; Quando você está em um contexto, a configuração em execução consiste apenas nesse contexto. Por exemplo, você não pode ver todas as configurações em execução (sistema mais todos os contextos) digitando o comando show running-config . Somente a configuração atual é exibida.
Parece que você precisa estar no contexto para escrever as alterações.
Edit: A começou a receber documentação que lhe dizer como salvar vários contextos, ao mesmo tempo, usando a memória de gravação tudo