Suponha que eu tenha alguma medida para cada assunto em cada site. Duas variáveis, assunto e site, são de interesse em termos de computação de valores de correlação intraclasse (ICC). Normalmente eu usaria a função lmer
do pacote R lme4
e executava
lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | site), mydata)
Os valores de ICC podem ser obtidos a partir das variações dos efeitos aleatórios no modelo acima.
No entanto, li recentemente um artigo que realmente me intriga. Usando o exemplo acima, os autores calcularam três valores de ICC no artigo com a função lme do pacote nlme: um para o assunto, um para o site e outro para a interação entre o assunto e o site. Não foram fornecidos mais detalhes no artigo. Estou confuso das duas perspectivas a seguir:
- Como calcular os valores de ICC com lme? Não sei como especificar esses três efeitos aleatórios (assunto, site e sua interação) no lme.
- É realmente significativo considerar o TPI para a interação de assunto e site? Da modelagem ou da perspectiva teórica, você pode calcular, mas conceitualmente tenho problemas para interpretar essa interação.
r
lme4-nlme
intraclass-correlation
pólo azul
fonte
fonte
Respostas:
A fórmula do modelo R
se encaixa no modelo
onde é o k 'th de i em j , η i é o sujeito i efeito aleatório, θ j é o site j efeito aleatório e ε i j k é o restante do erro. Esses efeitos aleatórios têm variações σ 2 η , σ 2 θ , σ 2 ε que são estimadas pelo modelo. (Observe que, se o assunto estiver aninhado no site, você escreveria tradicionalmente θ i jYijk k i j ηi i θj j εijk σ2η,σ2θ,σ2ε θij aqui em vez de ).θj
measurement
subject
site
Para responder à sua primeira pergunta sobre como calcular os ICCs: neste modelo, os ICCs são a proporção da variação total explicada pelo respectivo fator de bloqueio. Em particular, a correlação entre duas observações selecionadas aleatoriamente sobre o mesmo assunto é:
A correlação entre duas observações selecionadas aleatoriamente do mesmo site é:
A correlação entre duas observações selecionadas aleatoriamente no mesmo indivíduo e no mesmo local (a chamada interação ICC) é:
Subject
site
Cada uma dessas quantidades pode ser estimada inserindo as estimativas dessas variações que resultam do ajuste do modelo.
Subject
Subject
site
site
fonte