eles são:
Disco virtual que armazena o conteúdo de um disco rígido da máquina virtual VMware; pode ser acessado como um disco rígido físico com o software VMware; normalmente chamado "[vmname] .vdmk;" pode ser definido em um tamanho fixo ou configurado para crescer com o tempo usando o Virtual Disk Manager da VMware.
Os arquivos VDMK são usados pelo software VMware, mas também podem ser montados como um disco virtual usando o WinMount. Depois que o arquivo VDMK tiver sido montado com o WinMount, os usuários poderão excluir, copiar e modificar arquivos no disco virtual.
De: http://www.fileinfo.com/extension/vmdk
Como você pode ver, eles são arquivos de dados para suas máquinas virtuais. Se você excluí-los, provavelmente perderá dados e danificará sua VM - por isso, não recomendo excluí-los, a menos que você queira se livrar de sua máquina virtual ...