Estou fazendo uma regressão multivariada de Cox, tenho minhas variáveis independentes significativas e valores beta. O modelo se ajusta muito bem aos meus dados.
Agora, eu gostaria de usar meu modelo e prever a sobrevivência de uma nova observação. Não estou claro como fazer isso com um modelo de Cox. Em uma regressão linear ou logística, seria fácil, basta colocar os valores de nova observação na regressão e multiplicá-los por betas e, portanto, tenho a previsão do meu resultado.
Como posso determinar meu risco de linha de base? Eu preciso disso, além de calcular a previsão.
Como isso é feito em um modelo de Cox?
validate
função norms
pacote R em conjunto com acph
função fará isso. O único algoritmo stepwise implementadovalidate
é o retrocesso reverso.A função
predictSurvProb
nopec
pacote pode fornecer estimativas de risco absolutas para novos dados com base em um modelo cox existente, se você usar R.Os detalhes matemáticos que não posso explicar.
EDIT: A função fornece probabilidades de sobrevivência, que até agora consideramos 1- (Probabilidade de evento).
EDIT 2:
Pode-se fazer sem o pacote pec. Usando apenas o pacote de sobrevivência, a função a seguir retorna risco absoluto com base no modelo de Cox
fonte
muhaz
pacotes em R).S(t)=exp(−Λ(t))
ondeΛ(t)
está o risco cumulativo.Talvez você também gostaria de tentar algo assim? Ajuste um modelo de riscos proporcionais de Cox e use-o para obter a curva de sobrevivência prevista para uma nova instância.
Retirado do arquivo de ajuda do survfit.coxph em R (acabei de adicionar a parte das linhas)
Você deve ter em mente que, para que a suposição de riscos proporcionais ainda seja válida para sua previsão, o paciente para o qual você prediz deve pertencer a um grupo qualitativamente igual ao usado para derivar o modelo de riscos proporcionais de Cox que você usou para a previsão. predição.
fonte
A
basehaz
função dossurvival
pacotes fornece o risco da linha de base nos pontos de tempo do evento. A partir disso, você pode trabalhar a matemática que o ocram fornece e incluir os ORs de suas estimativas de coxph.fonte
O ponto principal do modelo de Cox é a suposição do risco proporcional e o uso do likelhood parcial. A probabilidade parcial tem a função de risco de base eliminada. Portanto, você não precisa especificar um. Essa é a beleza disso!
fonte
rms
.