Estou tentando entender como dinterval () funciona no JAGS para dados censurados. Estou modelando dados grosseiros, onde só tenho limites superior e inferior para cada ponto de dados (não o valor verdadeiro). Aqui está um exemplo simples de como acho que deve funcionar:
Alguns limites superior e inferior para cada ponto:
> head(lim)
L U
[1,] 14.98266 15.68029
[2,] 21.21827 21.91590
[3,] 18.34953 19.04716
[4,] 19.00186 19.69949
[5,] 15.39891 16.09654
[6,] 17.81705 18.51468
Uma função para escrever o modelo (supondo que os dados sejam normais, com média e variância comuns):
playmodel <- function(){
for (i in 1:50){
is.censored[i] ~ dinterval(t[i], lim[i,])
t[i] ~ dnorm(mu,tau)
}
mu ~ dnorm(0,.001)
tau ~ dgamma(.01,.01)
}
filename <- "toymod.bug"
write.model(toymod,filename)
Algumas funções e atribuições dos jags chamam:
data <- list("lim"=lim)
inits <- list(mu=rnorm(1),tau=rgamma(1,.01,.01),t=as.vector(apply(lim,1,mean)))
#last part is to ensure the starting value is between the upper and lower limit
#each chain will start at the same place for t but this is just for this case
params <- c("mu","tau")
E execute o modelo:
playmodel.jags <- jags(data,inits, params, model.file="toymod.bug", n.chains=3,
n.iter=50000,n.burnin=30000, n.thin=1, DIC=TRUE,
working.directory=NULL,refresh = 50000/50, progress.bar = "text")
O que acontece quando eu corro isso?
1) minha estimativa de mu fica em torno de 0 quando deveria ser 15
2) não será executado se DIC = TRUE:
error: "Erro no jags.samples (model, variable.names, n.iter, thin, type =" trace ",: Falha ao configurar o monitor de rastreamento para desvio de nó
Nota: Posso obter um modelo semelhante em execução no OpenBUGS, omitindo a linha dinterval () e anexando I (Lower, Upper) ao dnorm.
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