Trabalhos acadêmicos em computação científica (e em muitos outros campos atualmente) normalmente envolvem uma certa quantidade de código ou mesmo pacotes de software completos que foram escritos especificamente para esse trabalho ou que foram usados para obter resultados no trabalho. Qual é a...
O software é uma parte fundamental da ciência computacional e é cada vez mais reconhecido como uma parte essencial do registro científico. Dado o valor de usar códigos existentes e bem testados, parece valer a pena comunicar a existência de códigos úteis o mais amplamente possível e creditar seus...
O Journal of Computational Physics tem sido uma saída importante para a ciência da computação no passado, e eu já o publiquei antes. Para o benefício daqueles (como eu) que assinaram o boicote à Elsevier , que periódicos não pertencentes à Elsevier seriam lugares apropriados para publicar artigos...
A reprodutibilidade se tornou cada vez mais importante na pesquisa em ciências computacionais. (Por exemplo, consulte este artigo de Roger Peng na Science ; também conheço outros artigos e sites da Web.) No entanto, não está claro para mim quanta informação devo incluir em um artigo de revista (ou...
A pesquisa reproduzível em computação visa disponibilizar a outros pesquisadores o código necessário para gerar os resultados em um artigo computacional, para que eles possam executar esse código para reproduzir os resultados nesse artigo. Gostaria de tornar toda a minha pesquisa reproduzível, mas...
Digamos que eu tenha versões lentas e rápidas de algum código e queira relatar um número de aceleração comparando os dois. Eu executo a versão lenta times e a versão rápida m times, produzindo times ( s 1 , … , s n ) e ( f 1 , … , f m ) . A maneira mais simples de produzir uma aceleração é calcular...
(Espero que esta pergunta se encaixe neste site; caso contrário, aceite minhas desculpas). Fiz uma certa simulação e obtive uma série temporal y (t), t = 0, 1, ... 20. Depois de tentar algumas funções, descobri que: y(t) =~ 1 / (A t + B) Onde A e B são coeficientes calculados usando regressão...
Atualmente, estou produzindo imagens 1d e 2d usando o Matlab para comparação de precisão em relação a um determinado modelo. Preciso comparar meus métodos com o modelo gaussiano .wfn padrão e farei isso analisando a densidade de uma molécula e também o laplaciano. Estou interessado em produzir...
Existe uma lista publicada de melhores práticas para garantir a longevidade do código, visando resultados científicos reproduzíveis? (por exemplo, código aberto, práticas de documentação, seleção de dependências, seleção de idioma, máquinas virtuais etc.). Conhece estudos (ou faltam exemplos /...
Eu resolvo muitos PDEs numericamente, mas a matemática aplicada não é o meu campo. Ainda não entendi quais diários de matemática aplicada devo ler para acompanhar os desenvolvimentos recentes no campo. Quais são os bons periódicos a serem lidos para acompanhar os desenvolvimentos recentes na...
Ouvi dizer que alguns periódicos têm uma classificação mais alta do que outros. Isso é verdade? E se sim, quais são os critérios para julgar o valor de um periódico revisado por pares em detrimento de outro? Como descubro sua classificação? Minha publicação terá menos "valor" se for aceita em um...
Qual é uma maneira comum e boa de expressar dicionários (= mapas) no pseudocódigo? Ou seja, estruturas de dados que basicamente permitem armazenar valores para chaves, iterar sobre todos os pares chave / valor, testar a inclusão de uma determinada chave etc. Eu tenho algo parecido com o seguinte...
Eu já vi muitas publicações em periódicos de Física Computacional usarem métricas diferentes para o desempenho de seu código. Especialmente para o código GPGPU, parece haver uma grande variedade de resultados de tempo publicados pelas pessoas. Em particular, eu já vi: Comparações de...
Quero publicar o pacote de software que escrevi para meu trabalho de pós-graduação, juntamente com um artigo descrevendo o pacote. Até agora, estive considerando licenças liberais como o BSD. No entanto, agora estou ciente de que a publicação do seu código pode envolver um acordo com os termos de...